Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G154400.1
Synonym Sb10g020810
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z3N6
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02360 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g27580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G099050 - -
2 Sobic.007G012500 - -
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13 Sobic.010G144600 - -
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18 Sobic.010G130900 glycine rich protein family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G123650 - -
20 Sobic.001G123650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G154400 Sobic010G154400 Sobic004G099050 Sobic004G099050 Sobic010G154400--Sobic004G099050 Sobic007G012500 Sobic007G012500 Sobic010G154400--Sobic007G012500 Sobic001G461600 Sobic001G461600 Sobic010G154400--Sobic001G461600 Sobic004G254300 Sobic004G254300 Sobic010G154400--Sobic004G254300 Sobic004G277501 Sobic004G277501 Sobic010G154400--Sobic004G277501 Sobic003G175300 Sobic003G175300 Sobic010G154400--Sobic003G175300 Sobic007G035900 Sobic007G035900 Sobic010G154400--Sobic007G035900 Sobic007G218400 Sobic007G218400 Sobic010G154400--Sobic007G218400 Sobic003G369800 Sobic003G369800 Sobic010G154400--Sobic003G369800 Sobic004G099050--Sobic010G154400 Sobic004G099050--Sobic007G012500 Sobic004G099050--Sobic004G254300 Sobic001G123650 Sobic001G123650 Sobic004G099050--Sobic001G123650 Sobic007G012500--Sobic004G099050 Sobic007G012500--Sobic010G154400 Sobic007G012500--Sobic001G461600 Sobic007G012500--Sobic004G254300 Sobic007G012500--Sobic007G218400 Sobic009G059866 Sobic009G059866 Sobic007G012500--Sobic009G059866 Sobic009G059932 Sobic009G059932 Sobic007G012500--Sobic009G059932 Sobic009G059800 Sobic009G059800 Sobic007G012500--Sobic009G059800 Sobic006G076000 Sobic006G076000 Sobic007G012500--Sobic006G076000 Sobic001G461600--Sobic010G154400 Sobic001G461600--Sobic007G012500 Sobic001G461600--Sobic004G277501 Sobic001G461600--Sobic004G099050 Sobic001G461600--Sobic004G254300 Sobic004G316100 Sobic004G316100 Sobic001G461600--Sobic004G316100 Sobic001G461600--Sobic003G369800 Sobic001G461600--Sobic007G218400 Sobic003G232800 Sobic003G232800 Sobic001G461600--Sobic003G232800 Sobic004G254300--Sobic009G059866 Sobic004G254300--Sobic009G059932 Sobic004G254300--Sobic007G218400 Sobic004G056500 Sobic004G056500 Sobic004G254300--Sobic004G056500 Sobic002G102800 Sobic002G102800 Sobic004G254300--Sobic002G102800 Sobic004G254300--Sobic009G059800 Sobic010G237400 Sobic010G237400 Sobic004G254300--Sobic010G237400 Sobic004G254300--Sobic003G369800 Sobic010G144600 Sobic010G144600 Sobic004G254300--Sobic010G144600 Sobic004G277501--Sobic004G316100 Sobic004G277501--Sobic003G232800 Sobic004G277501--Sobic010G154400 Sobic004G277501--Sobic003G175300 Sobic004G277501--Sobic001G461600 Sobic004G277501--Sobic007G035900 Sobic004G277501--Sobic003G369800 Sobic004G277501--Sobic004G254300 Sobic002G023500 Sobic002G023500 Sobic004G277501--Sobic002G023500 Sobic003G175300--Sobic007G035900 Sobic003G175700 Sobic003G175700 Sobic003G175300--Sobic003G175700 Sobic003G175300--Sobic010G144600 Sobic003G175300--Sobic003G369800 Sobic006G239600 Sobic006G239600 Sobic003G175300--Sobic006G239600 Sobic003G175300--Sobic002G023500 Sobic007G014300 Sobic007G014300 Sobic003G175300--Sobic007G014300 Sobic003G175300--Sobic001G123650 Sobic007G035900--Sobic003G175700 Sobic007G035900--Sobic003G175300 Sobic007G035900--Sobic006G239600 Sobic007G035900--Sobic007G014300 Sobic007G035900--Sobic001G123650 Sobic007G218400--Sobic009G059932 Sobic007G218400--Sobic009G059866 Sobic007G218400--Sobic009G059800 Sobic007G218400--Sobic002G102800 Sobic007G218400--Sobic004G056500 Sobic007G218400--Sobic010G237400 Sobic007G218400--Sobic010G144600 Sobic007G218400--Sobic003G369800 Sobic007G218400--Sobic004G254300 Sobic003G369800--Sobic010G237400 Sobic003G369800--Sobic003G175300 Sobic003G369800--Sobic009G059800 Sobic003G369800--Sobic002G102800 Sobic003G369800--Sobic009G059932 Sobic003G369800--Sobic004G056500 Sobic003G369800--Sobic010G144600 Sobic003G369800--Sobic009G059866 Sobic003G369800--Sobic007G218400
Octagon: transcription factors


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