Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G191450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTX6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G020700 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
2 Sobic.004G221600 - -
3 Sobic.005G223300 DEFL16 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
4 Sobic.007G040400 - -
5 Sobic.005G147400 - -
6 Sobic.005G196400 DEF6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
7 Sobic.008G120200 - -
8 Sobic.010G191500 - -
9 Sobic.001G505400 expressed protein -
10 Sobic.005G080700 - -
11 Sobic.002G399700 pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.010G120100 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G031200 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
14 Sobic.005G153100 - -
15 Sobic.002G058000 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
16 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.005G189700 expressed protein -
18 Sobic.004G048500 - -
19 Sobic.001G209701 - -
20 Sobic.001G209701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic006G020700 Sobic006G020700 Sobic010G191450--Sobic006G020700 Sobic004G221600 Sobic004G221600 Sobic010G191450--Sobic004G221600 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic010G191450--Sobic005G223300 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic010G191450--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic010G191450--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic010G191450--Sobic005G196400 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic010G191450--Sobic008G120200 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic010G191450--Sobic010G191500 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic010G191450--Sobic001G505400 Sobic006G020700--Sobic010G191450 Sobic006G020700--Sobic004G221600 Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic006G020700--Sobic006G194800 Sobic006G020700--Sobic005G223300 Sobic003G285200 Sobic003G285200 Sobic006G020700--Sobic003G285200 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic006G020700--Sobic001G209701 Sobic004G221600--Sobic001G209701 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic005G223300--Sobic010G120100 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic005G223300--Sobic002G031200 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic005G223300--Sobic005G080700 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic005G223300--Sobic005G189700 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic005G223300--Sobic004G048500 Sobic005G223300--Sobic001G505400 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic005G223300--Sobic002G058000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic005G223300--Sobic004G315900 Sobic005G223300--Sobic005G147400 Sobic007G040400--Sobic005G147400 Sobic007G040400--Sobic005G196400 Sobic007G040400--Sobic001G505400 Sobic007G040400--Sobic008G120200 Sobic007G040400--Sobic005G223300 Sobic007G040400--Sobic005G080700 Sobic007G040400--Sobic010G120100 Sobic007G040400--Sobic002G031200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic007G040400--Sobic002G399700 Sobic005G147400--Sobic007G040400 Sobic005G147400--Sobic005G196400 Sobic005G147400--Sobic001G505400 Sobic005G147400--Sobic005G223300 Sobic005G147400--Sobic005G080700 Sobic005G147400--Sobic010G120100 Sobic005G147400--Sobic002G031200 Sobic005G147400--Sobic005G189700 Sobic005G147400--Sobic008G120200 Sobic005G196400--Sobic005G147400 Sobic005G196400--Sobic007G040400 Sobic005G196400--Sobic001G505400 Sobic005G196400--Sobic005G080700 Sobic005G196400--Sobic005G223300 Sobic005G196400--Sobic010G120100 Sobic005G196400--Sobic002G031200 Sobic005G196400--Sobic005G189700 Sobic005G196400--Sobic004G048500 Sobic008G120200--Sobic007G040400 Sobic008G120200--Sobic005G147400 Sobic008G120200--Sobic005G196400 Sobic008G120200--Sobic002G399700 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic008G120200--Sobic005G147100 Sobic008G120200--Sobic001G505400 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic008G120200--Sobic005G153100 Sobic008G120200--Sobic002G058000 Sobic008G120200--Sobic004G315900 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic010G191500--Sobic005G223000 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic010G191500--Sobic008G045650 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic010G191500--Sobic005G221100 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic010G191500--Sobic005G145900 Sobic010G191500--Sobic005G147100 Sobic010G191500--Sobic008G120200 Sobic010G191500--Sobic005G196400 Sobic010G191500--Sobic007G040400 Sobic010G191500--Sobic005G147400 Sobic001G505400--Sobic005G080700 Sobic001G505400--Sobic005G196400 Sobic001G505400--Sobic005G147400 Sobic001G505400--Sobic005G223300 Sobic001G505400--Sobic007G040400 Sobic001G505400--Sobic004G048500 Sobic001G505400--Sobic005G189700 Sobic001G505400--Sobic001G209701
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.