Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G177600.2
Synonym Sb01g015450
Functional annotation OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S665
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF126
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g46510.1 : OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G057750 - -
2 Sobic.005G124500 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
3 Sobic.002G275800 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
4 Sobic.001G515400 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
5 Sobic.006G030250 - -
6 Sobic.002G277000 - -
7 Sobic.001G448900 OsFBX210 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G270301 - -
9 Sobic.008G174400 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G373500 OsFBX152 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
12 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
14 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
15 Sobic.009G220600 - -
16 Sobic.002G191200 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G083932 - -
18 Sobic.007G115050 - -
19 Sobic.010G127500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G079200 EF hand family protein, putative, expressed K02183: calmodulin


Gene co-expression network
sample Sobic001G177600 Sobic001G177600 Sobic005G057750 Sobic005G057750 Sobic001G177600--Sobic005G057750 Sobic005G124500 Sobic005G124500 Sobic001G177600--Sobic005G124500 Sobic002G275800 Sobic002G275800 Sobic001G177600--Sobic002G275800 Sobic001G515400 Sobic001G515400 Sobic001G177600--Sobic001G515400 Sobic006G030250 Sobic006G030250 Sobic001G177600--Sobic006G030250 Sobic002G277000 Sobic002G277000 Sobic001G177600--Sobic002G277000 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic001G177600--Sobic001G448900 Sobic001G270301 Sobic001G270301 Sobic001G177600--Sobic001G270301 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic001G177600--Sobic008G174400 Sobic005G057750--Sobic001G177600 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic005G057750--Sobic008G180600 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic005G057750--Sobic003G048300 Sobic009G220600 Sobic009G220600 Sobic005G057750--Sobic009G220600 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic005G057750--Sobic002G255800 Sobic001G364900 Sobic001G364900 Sobic005G057750--Sobic001G364900 Sobic005G057750--Sobic002G275800 Sobic002G190400 Sobic002G190400 Sobic005G057750--Sobic002G190400 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic005G057750--Sobic003G224800 Sobic005G124500--Sobic002G190400 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic005G124500--Sobic002G104600 Sobic003G118650 Sobic003G118650 Sobic005G124500--Sobic003G118650 Sobic003G079725 Sobic003G079725 Sobic005G124500--Sobic003G079725 Sobic002G002000 Sobic002G002000 Sobic005G124500--Sobic002G002000 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic005G124500--Sobic006G143800 Sobic001G134900 Sobic001G134900 Sobic005G124500--Sobic001G134900 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G124500--Sobic006G078450 Sobic001G488300 Sobic001G488300 Sobic005G124500--Sobic001G488300 Sobic008G101850 Sobic008G101850 Sobic002G275800--Sobic008G101850 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic002G275800--Sobic006G067300 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic002G275800--Sobic004G089400 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic002G275800--Sobic005G006701 Sobic002G290600 Sobic002G290600 Sobic002G275800--Sobic002G290600 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic002G275800--Sobic004G149200 Sobic010G043300 Sobic010G043300 Sobic002G275800--Sobic010G043300 Sobic001G215201 Sobic001G215201 Sobic002G275800--Sobic001G215201 Sobic003G062900 Sobic003G062900 Sobic002G275800--Sobic003G062900 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G515400--Sobic004G198701 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic001G515400--Sobic003G168350 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic001G515400--Sobic003G200400 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic001G515400--Sobic005G008400 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic001G515400--Sobic001G365332 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic001G515400--Sobic002G014900 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic001G515400--Sobic006G005550 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic001G515400--Sobic008G157700 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic001G515400--Sobic004G346700 Sobic010G127500 Sobic010G127500 Sobic006G030250--Sobic010G127500 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic006G030250--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic006G030250--Sobic005G083932 Sobic006G030250--Sobic008G174400 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic006G030250--Sobic002G191200 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic006G030250--Sobic002G373500 Sobic002G277000--Sobic001G317900 Sobic002G277000--Sobic005G083932 Sobic002G277000--Sobic008G174400 Sobic002G277000--Sobic002G191200 Sobic002G277000--Sobic002G373500 Sobic002G277000--Sobic010G127500 Sobic001G448900--Sobic002G277000 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic001G448900--Sobic009G206150 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic001G448900--Sobic007G115050 Sobic001G448900--Sobic002G191200 Sobic001G448900--Sobic005G083932 Sobic001G448900--Sobic001G317900 Sobic001G270301--Sobic009G206150 Sobic001G270301--Sobic001G448900 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic001G270301--Sobic002G215932 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic001G270301--Sobic001G071250 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic001G270301--Sobic001G417100 Sobic001G270301--Sobic007G115050 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic001G270301--Sobic007G135301 Sobic001G270301--Sobic001G317900 Sobic008G174400--Sobic001G317900 Sobic008G174400--Sobic002G373500 Sobic008G174400--Sobic005G083932 Sobic008G174400--Sobic002G191200 Sobic008G174400--Sobic010G127500 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic008G174400--Sobic007G080660
Octagon: transcription factors


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