Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G057750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH33
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g07330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G177600 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G180600 pre-rRNA-processing protein TSR2, putative, expressed K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
3 Sobic.003G048300 - -
4 Sobic.009G220600 - -
5 Sobic.002G255800 expressed protein -
6 Sobic.001G364900 expressed protein -
7 Sobic.002G275800 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
8 Sobic.002G190400 ZOS9-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.003G224800 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G486800 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G065700 expressed protein -
12 Sobic.003G118650 - -
13 Sobic.008G188950 - -
14 Sobic.004G355900 oligopeptide transporter, putative, expressed -
15 Sobic.005G077600 OsFBO22 - F-box and other domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G103400 MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
17 Sobic.007G057201 - -
18 Sobic.005G124500 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
19 Sobic.003G127900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G009900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G057750 Sobic005G057750 Sobic001G177600 Sobic001G177600 Sobic005G057750--Sobic001G177600 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic005G057750--Sobic008G180600 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic005G057750--Sobic003G048300 Sobic009G220600 Sobic009G220600 Sobic005G057750--Sobic009G220600 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic005G057750--Sobic002G255800 Sobic001G364900 Sobic001G364900 Sobic005G057750--Sobic001G364900 Sobic002G275800 Sobic002G275800 Sobic005G057750--Sobic002G275800 Sobic002G190400 Sobic002G190400 Sobic005G057750--Sobic002G190400 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic005G057750--Sobic003G224800 Sobic001G177600--Sobic005G057750 Sobic005G124500 Sobic005G124500 Sobic001G177600--Sobic005G124500 Sobic001G177600--Sobic002G275800 Sobic001G515400 Sobic001G515400 Sobic001G177600--Sobic001G515400 Sobic006G030250 Sobic006G030250 Sobic001G177600--Sobic006G030250 Sobic002G277000 Sobic002G277000 Sobic001G177600--Sobic002G277000 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic001G177600--Sobic001G448900 Sobic001G270301 Sobic001G270301 Sobic001G177600--Sobic001G270301 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic001G177600--Sobic008G174400 Sobic008G180600--Sobic002G255800 Sobic007G057201 Sobic007G057201 Sobic008G180600--Sobic007G057201 Sobic009G049701 Sobic009G049701 Sobic008G180600--Sobic009G049701 Sobic008G188950 Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic008G188950 Sobic008G180600--Sobic003G048300 Sobic004G355900 Sobic004G355900 Sobic008G180600--Sobic004G355900 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic008G180600--Sobic004G136400 Sobic003G065700 Sobic003G065700 Sobic008G180600--Sobic003G065700 Sobic008G145500 Sobic008G145500 Sobic008G180600--Sobic008G145500 Sobic003G048300--Sobic002G255800 Sobic003G048300--Sobic008G188950 Sobic003G048300--Sobic008G180600 Sobic001G486800 Sobic001G486800 Sobic003G048300--Sobic001G486800 Sobic003G048300--Sobic003G224800 Sobic003G048300--Sobic007G057201 Sobic003G048300--Sobic003G065700 Sobic003G048300--Sobic009G049701 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic003G048300--Sobic007G009900 Sobic010G144250 Sobic010G144250 Sobic009G220600--Sobic010G144250 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic009G220600--Sobic007G080660 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic009G220600--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic009G220600--Sobic005G083932 Sobic005G081700 Sobic005G081700 Sobic009G220600--Sobic005G081700 Sobic009G220600--Sobic008G174400 Sobic002G255800--Sobic008G180600 Sobic002G255800--Sobic008G188950 Sobic002G255800--Sobic007G057201 Sobic002G255800--Sobic003G048300 Sobic002G255800--Sobic001G486800 Sobic002G255800--Sobic009G049701 Sobic002G255800--Sobic003G224800 Sobic002G255800--Sobic008G145500 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic002G255800--Sobic001G024100 Sobic010G094400 Sobic010G094400 Sobic001G364900--Sobic010G094400 Sobic004G022366 Sobic004G022366 Sobic001G364900--Sobic004G022366 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic001G364900--Sobic002G013550 Sobic001G242200 Sobic001G242200 Sobic001G364900--Sobic001G242200 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic001G364900--Sobic003G018000 Sobic003G090200 Sobic003G090200 Sobic001G364900--Sobic003G090200 Sobic002G100300 Sobic002G100300 Sobic001G364900--Sobic002G100300 Sobic005G212300 Sobic005G212300 Sobic001G364900--Sobic005G212300 Sobic003G354850 Sobic003G354850 Sobic001G364900--Sobic003G354850 Sobic008G101850 Sobic008G101850 Sobic002G275800--Sobic008G101850 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic002G275800--Sobic006G067300 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic002G275800--Sobic004G089400 Sobic005G006701 Sobic005G006701 Sobic002G275800--Sobic005G006701 Sobic002G290600 Sobic002G290600 Sobic002G275800--Sobic002G290600 Sobic004G149200 Sobic004G149200 Sobic002G275800--Sobic004G149200 Sobic010G043300 Sobic010G043300 Sobic002G275800--Sobic010G043300 Sobic001G215201 Sobic001G215201 Sobic002G275800--Sobic001G215201 Sobic003G062900 Sobic003G062900 Sobic002G275800--Sobic003G062900 Sobic002G190400--Sobic005G124500 Sobic003G118650 Sobic003G118650 Sobic002G190400--Sobic003G118650 SobicK031500 SobicK031500 Sobic002G190400--SobicK031500 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic002G190400--Sobic002G104600 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic002G190400--Sobic006G143800 Sobic001G134900 Sobic001G134900 Sobic002G190400--Sobic001G134900 Sobic002G002000 Sobic002G002000 Sobic002G190400--Sobic002G002000 Sobic002G190400--Sobic005G057750 Sobic002G190400--Sobic009G220600 Sobic003G224800--Sobic008G188950 Sobic003G224800--Sobic002G255800 Sobic002G217800 Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic002G217800 Sobic003G224800--Sobic008G180600 Sobic003G224800--Sobic007G057201 Sobic003G224800--Sobic003G048300 Sobic003G224800--Sobic001G024100 Sobic003G224800--Sobic004G136400 Sobic003G224800--Sobic003G065700
Octagon: transcription factors


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