Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G190400.1,Sobic.002G190400.2,Sobic.002G190400.3
Synonym Sb02g023780
Functional annotation ZOS9-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A1B6QC97
Pfam -
Panther DB PTHR23272 PTHR23272:SF38 PTHR23272:SF38 PTHR23272
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G42170 : BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g21420.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G190400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G124500 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
2 Sobic.003G118650 - -
3 Sobic.K031500 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
4 Sobic.002G104600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G143800 - -
6 Sobic.001G134900 exostosin, putative, expressed -
7 Sobic.002G002000 expressed protein -
8 Sobic.005G057750 - -
9 Sobic.009G220600 - -
10 Sobic.010G103400 MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
11 Sobic.006G063800 HIRAN domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G070100 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
13 Sobic.002G118500 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G231900 SPRY-domain containing protein, putative, expressed K15047: HNRNPUL1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1
15 Sobic.003G224900 - -
16 Sobic.009G196900 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA"(PubMedID : 20499123)@down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@auxin response factor 14, putative, expressed K14486: K14486, auxin response factor
17 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
18 Sobic.004G081701 - -
19 Sobic.003G079725 - -
20 Sobic.005G156450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G190400 Sobic002G190400 Sobic005G124500 Sobic005G124500 Sobic002G190400--Sobic005G124500 Sobic003G118650 Sobic003G118650 Sobic002G190400--Sobic003G118650 SobicK031500 SobicK031500 Sobic002G190400--SobicK031500 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic002G190400--Sobic002G104600 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic002G190400--Sobic006G143800 Sobic001G134900 Sobic001G134900 Sobic002G190400--Sobic001G134900 Sobic002G002000 Sobic002G002000 Sobic002G190400--Sobic002G002000 Sobic005G057750 Sobic005G057750 Sobic002G190400--Sobic005G057750 Sobic009G220600 Sobic009G220600 Sobic002G190400--Sobic009G220600 Sobic005G124500--Sobic002G190400 Sobic005G124500--Sobic002G104600 Sobic005G124500--Sobic003G118650 Sobic003G079725 Sobic003G079725 Sobic005G124500--Sobic003G079725 Sobic005G124500--Sobic002G002000 Sobic005G124500--Sobic006G143800 Sobic005G124500--Sobic001G134900 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G124500--Sobic006G078450 Sobic001G488300 Sobic001G488300 Sobic005G124500--Sobic001G488300 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic003G118650--Sobic004G346800 Sobic003G118650--Sobic001G134900 Sobic003G118650--Sobic006G143800 Sobic003G118650--Sobic002G002000 Sobic003G288500 Sobic003G288500 Sobic003G118650--Sobic003G288500 Sobic003G118650--Sobic003G079725 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G118650--Sobic006G017266 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic003G118650--Sobic001G045500 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G118650--Sobic009G069450 SobicK031500--Sobic002G190400 SobicK031500--Sobic005G124500 Sobic007G070100 Sobic007G070100 SobicK031500--Sobic007G070100 Sobic003G224900 Sobic003G224900 SobicK031500--Sobic003G224900 Sobic010G241450 Sobic010G241450 SobicK031500--Sobic010G241450 Sobic001G332933 Sobic001G332933 SobicK031500--Sobic001G332933 Sobic005G156450 Sobic005G156450 SobicK031500--Sobic005G156450 Sobic002G276500 Sobic002G276500 SobicK031500--Sobic002G276500 SobicK031500--Sobic002G104600 Sobic007G164101 Sobic007G164101 Sobic002G104600--Sobic007G164101 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic002G104600--Sobic005G093600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic002G104600--Sobic006G147350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic002G104600--Sobic003G128575 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic002G104600--Sobic006G020350 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic002G104600--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G104600--Sobic003G255850 Sobic006G143800--Sobic003G288500 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic006G143800--Sobic003G119750 Sobic003G354166 Sobic003G354166 Sobic006G143800--Sobic003G354166 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic006G143800--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic006G143800--Sobic006G192600 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G143800--Sobic008G157700 Sobic006G143800--Sobic002G002000 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic006G143800--Sobic003G168800 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic006G143800--Sobic007G004750 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic001G134900--Sobic002G014900 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic001G134900--Sobic007G223250 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic001G134900--Sobic002G150032 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G134900--Sobic004G198701 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic001G134900--Sobic002G149966 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic001G134900--Sobic001G266000 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G134900--Sobic002G288700 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G134900--Sobic010G008433 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic001G134900--Sobic001G071250 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic002G002000--Sobic004G272500 Sobic002G002000--Sobic006G192600 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic002G002000--Sobic005G101400 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic002G002000--Sobic004G337600 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic002G002000--Sobic002G044500 Sobic002G002000--Sobic002G149966 Sobic002G002000--Sobic002G150032 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic002G002000--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic002G002000--Sobic003G172850 Sobic001G177600 Sobic001G177600 Sobic005G057750--Sobic001G177600 Sobic008G180600 Sobic008G180600 Sobic005G057750--Sobic008G180600 Sobic003G048300 Sobic003G048300 Sobic005G057750--Sobic003G048300 Sobic005G057750--Sobic009G220600 Sobic002G255800 Sobic002G255800 Sobic005G057750--Sobic002G255800 Sobic001G364900 Sobic001G364900 Sobic005G057750--Sobic001G364900 Sobic002G275800 Sobic002G275800 Sobic005G057750--Sobic002G275800 Sobic005G057750--Sobic002G190400 Sobic003G224800 Sobic003G224800 Sobic005G057750--Sobic003G224800 Sobic010G144250 Sobic010G144250 Sobic009G220600--Sobic010G144250 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic009G220600--Sobic007G080660 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic009G220600--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic009G220600--Sobic005G083932 Sobic005G081700 Sobic005G081700 Sobic009G220600--Sobic005G081700 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic009G220600--Sobic008G174400
Octagon: transcription factors


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