Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G104600.1,Sobic.002G104600.5,Sobic.002G104600.3,Sobic.002G104600.2,Sobic.002G104600.4
Synonym Sb02g008900
Functional annotation Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QAH3 , A0A1W0W3B3 , C5X3I8
Pfam PF00149
Panther DB PTHR14795 PTHR14795:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03305 : Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g17280.1 : Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026463
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G104600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.003G290050 - -
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19 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
20 Sobic.003G154200 serine carboxypeptidase, putative, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II


Gene co-expression network
sample Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic007G164101 Sobic007G164101 Sobic002G104600--Sobic007G164101 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic002G104600--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic002G104600--Sobic005G093600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic002G104600--Sobic006G147350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic002G104600--Sobic003G128575 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic002G104600--Sobic006G020350 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic002G104600--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G104600--Sobic003G255850 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic007G164101--Sobic005G183450 Sobic007G164101--Sobic006G147350 Sobic007G164101--Sobic003G128575 Sobic007G164101--Sobic006G017266 Sobic007G164101--Sobic005G093600 Sobic007G164101--Sobic010G173600 Sobic007G164101--Sobic006G020350 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic007G164101--Sobic006G005550 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic007G164101--Sobic009G069450 Sobic008G035633--Sobic006G020350 Sobic008G035633--Sobic005G183450 Sobic008G035633--Sobic003G128575 Sobic008G035633--Sobic006G017266 Sobic008G035633--Sobic005G093600 Sobic008G035633--Sobic006G005550 Sobic008G035633--Sobic010G173600 Sobic008G035633--Sobic006G147350 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic008G035633--Sobic001G365332 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic010G173600 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic003G255850 Sobic006G147350--Sobic005G093600 Sobic006G147350--Sobic003G128575 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic006G017266 Sobic006G147350--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic010G173600--Sobic005G093600 Sobic010G173600--Sobic003G128575 Sobic010G173600--Sobic006G147350 Sobic010G173600--Sobic006G017266 Sobic010G173600--Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic003G255850 Sobic010G173600--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G183450 Sobic010G173600--Sobic002G322101 Sobic003G255850--Sobic010G173600 Sobic003G255850--Sobic006G147350 Sobic003G255850--Sobic002G322101 Sobic003G255850--Sobic005G093600 Sobic003G255850--Sobic007G149750 Sobic003G255850--Sobic003G128575 Sobic003G255850--Sobic006G017266 Sobic003G255850--Sobic006G020350 Sobic003G255850--Sobic001G249900
Octagon: transcription factors


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