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Transcriptome id Sobic.006G143800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YBZ7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G288500 - -
2 Sobic.003G119750 - -
3 Sobic.003G354166 - -
4 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
5 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
6 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G002000 expressed protein -
8 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
9 Sobic.007G004750 - -
10 Sobic.006G145650 - -
11 Sobic.003G344300 - -
12 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G118650 - -
14 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
15 Sobic.001G134900 exostosin, putative, expressed -
16 Sobic.002G150032 - -
17 Sobic.003G172850 - K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
18 Sobic.001G222150 - -
19 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G132200 inhibitor I family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic003G288500 Sobic003G288500 Sobic006G143800--Sobic003G288500 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic006G143800--Sobic003G119750 Sobic003G354166 Sobic003G354166 Sobic006G143800--Sobic003G354166 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic006G143800--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic006G143800--Sobic006G192600 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G143800--Sobic008G157700 Sobic002G002000 Sobic002G002000 Sobic006G143800--Sobic002G002000 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic006G143800--Sobic003G168800 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic006G143800--Sobic007G004750 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G288500--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G288500--Sobic005G093600 Sobic003G288500--Sobic007G004750 Sobic003G288500--Sobic001G293900 Sobic003G288500--Sobic008G157700 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic003G288500--Sobic010G173600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G288500--Sobic003G128575 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic003G288500--Sobic006G124850 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic003G288500--Sobic002G322101 Sobic003G119750--Sobic001G293900 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic003G119750--Sobic003G344300 Sobic003G119750--Sobic007G004750 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic003G119750--Sobic010G132200 Sobic003G119750--Sobic003G168800 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G119750--Sobic003G423400 Sobic003G119750--Sobic006G192600 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G119750--Sobic001G128000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G119750--Sobic003G169400 Sobic003G354166--Sobic001G293900 Sobic003G354166--Sobic007G004750 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic003G354166--Sobic003G255850 Sobic003G354166--Sobic003G128575 Sobic003G354166--Sobic003G119750 Sobic003G354166--Sobic006G017266 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic003G354166--Sobic005G183450 Sobic003G354166--Sobic010G132200 Sobic003G354166--Sobic006G124850 Sobic001G293900--Sobic003G119750 Sobic001G293900--Sobic010G132200 Sobic001G293900--Sobic003G169400 Sobic001G293900--Sobic003G168800 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic001G293900--Sobic003G172850 Sobic001G293900--Sobic003G423400 Sobic001G293900--Sobic006G124850 Sobic001G293900--Sobic006G192600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic001G293900--Sobic003G168500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic003G168500 Sobic006G192600--Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G168800 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic002G044500 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic006G192600--Sobic004G251400 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic003G172400 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic006G192600--Sobic002G165200 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic006G192600--Sobic008G160300 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic002G002000--Sobic004G272500 Sobic002G002000--Sobic006G192600 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic002G002000--Sobic005G101400 Sobic002G002000--Sobic004G337600 Sobic002G002000--Sobic002G044500 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic002G002000--Sobic002G149966 Sobic002G002000--Sobic002G150032 Sobic002G002000--Sobic003G168500 Sobic002G002000--Sobic003G172850 Sobic003G168800--Sobic003G172850 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G168800--Sobic010G052866 Sobic003G168800--Sobic003G344300 Sobic003G168800--Sobic006G192600 Sobic003G168800--Sobic001G293900 Sobic003G168800--Sobic010G132200 Sobic003G168800--Sobic004G251400 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G168800--Sobic003G173266 Sobic003G168800--Sobic003G168500 Sobic007G004750--Sobic001G293900 Sobic007G004750--Sobic003G119750 Sobic007G004750--Sobic010G132200 Sobic007G004750--Sobic003G168800 Sobic007G004750--Sobic003G354166 Sobic007G004750--Sobic003G344300 Sobic007G004750--Sobic008G157700 Sobic007G004750--Sobic003G423400 Sobic007G004750--Sobic003G169400
Octagon: transcription factors


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