Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G145650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDX8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008005
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G010150.5 , HORVU4Hr1G010150.6 , HORVU4Hr1G010150.1
Wheat TraesCS4B02G060200 , TraesCS4D02G059900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G011100 - -
2 Sobic.003G159300 - -
3 Sobic.001G222150 - -
4 Sobic.002G220400 - -
5 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G150901 - -
7 Sobic.010G214950 - -
8 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
9 Sobic.004G013900 vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed -
10 Sobic.004G019550 - -
11 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G111050 - -
13 Sobic.001G039750 - -
14 Sobic.003G354050 - -
15 Sobic.001G234733 - -
16 Sobic.003G344300 - -
17 Sobic.007G223250 - -
18 Sobic.006G143800 - -
19 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G251400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic006G145650--Sobic007G011100 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic006G145650--Sobic003G159300 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic006G145650--Sobic001G222150 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic006G145650--Sobic002G220400 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G145650--Sobic008G157700 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic006G145650--Sobic001G150901 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic006G145650--Sobic010G214950 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic006G145650--Sobic006G192600 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic006G145650--Sobic004G013900 Sobic007G011100--Sobic001G150901 Sobic007G011100--Sobic001G222150 Sobic007G011100--Sobic002G220400 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic007G011100--Sobic004G073300 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic007G011100--Sobic009G058900 Sobic007G011100--Sobic010G214950 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic007G011100--Sobic001G039750 Sobic001G524150 Sobic001G524150 Sobic007G011100--Sobic001G524150 Sobic010G186900 Sobic010G186900 Sobic007G011100--Sobic010G186900 Sobic003G277550 Sobic003G277550 Sobic003G159300--Sobic003G277550 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic003G159300--Sobic002G427600 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic003G159300--Sobic001G234733 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic003G159300--Sobic007G212250 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic003G159300--Sobic003G354050 Sobic001G382332 Sobic001G382332 Sobic003G159300--Sobic001G382332 Sobic002G406000 Sobic002G406000 Sobic003G159300--Sobic002G406000 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic003G159300--Sobic007G220033 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic003G159300--Sobic003G125751 Sobic001G222150--Sobic007G011100 Sobic001G222150--Sobic002G220400 Sobic010G058600 Sobic010G058600 Sobic001G222150--Sobic010G058600 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G222150--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G222150--Sobic004G019550 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic001G222150--Sobic006G122000 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic001G222150--Sobic003G344300 Sobic001G222150--Sobic001G150901 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G222150--Sobic003G286450 Sobic002G220400--Sobic004G019550 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic002G220400--Sobic001G118050 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic002G220400--Sobic006G135701 Sobic002G220400--Sobic001G154000 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic002G220400--Sobic009G260550 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic002G220400--Sobic004G252600 Sobic002G220400--Sobic001G222150 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic002G220400--Sobic006G100150 Sobic002G220400--Sobic007G011100 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic001G150901--Sobic007G011100 Sobic001G150901--Sobic010G214950 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G150901--Sobic002G288700 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic001G150901--Sobic005G146900 Sobic001G150901--Sobic001G222150 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic001G150901--Sobic003G159101 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic001G150901--Sobic005G036450 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G150901--Sobic006G123800 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G150901--Sobic002G423901 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic010G214950--Sobic001G059150 Sobic010G214950--Sobic001G150901 Sobic010G214950--Sobic007G011100 Sobic010G214950--Sobic001G234733 Sobic010G214950--Sobic005G146900 Sobic010G214950--Sobic004G013900 Sobic010G214950--Sobic002G288700 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic010G214950--Sobic007G223250 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic010G214950--Sobic003G200400 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic004G337600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic006G192600--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G172850 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic006G192600--Sobic003G168800 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic002G044500 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic006G192600--Sobic004G251400 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic003G172400 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic006G192600--Sobic002G165200 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic006G192600--Sobic008G160300 Sobic004G013900--Sobic010G214950 Sobic004G013900--Sobic001G059150 Sobic004G013900--Sobic001G150901 Sobic004G013900--Sobic007G011100 Sobic004G013900--Sobic001G222150 Sobic004G013900--Sobic006G145650 Sobic004G013900--Sobic002G423901 Sobic004G013900--Sobic007G223250 Sobic004G013900--Sobic002G288700
Octagon: transcription factors


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