Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G013900.2,Sobic.004G013900.1
Synonym VHA-A1
Functional annotation vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed
UniProt A0A194YM85
Pfam -
Panther DB PTHR11629 PTHR11629:SF72
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0015078; proton transmembrane transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28520 : vacuolar proton ATPase A1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61780.1 : vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039712
Brachypodium KQK10454
Barley -
Wheat TraesCS3B02G385500 , TraesCS3B02G385500 , TraesCS3A02G352800 , TraesCS3A02G352800 , TraesCS3D02G346900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
18 Sobic.003G031001 - -
19 Sobic.005G036450 - -
20 Sobic.005G146900 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic004G013900--Sobic010G214950 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic004G013900--Sobic001G059150 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic004G013900--Sobic001G150901 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic004G013900--Sobic007G011100 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic004G013900--Sobic001G222150 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic004G013900--Sobic006G145650 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic004G013900--Sobic002G423901 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G013900--Sobic007G223250 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic004G013900--Sobic002G288700 Sobic010G214950--Sobic001G059150 Sobic010G214950--Sobic001G150901 Sobic010G214950--Sobic007G011100 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic010G214950--Sobic001G234733 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic010G214950--Sobic005G146900 Sobic010G214950--Sobic004G013900 Sobic010G214950--Sobic002G288700 Sobic010G214950--Sobic007G223250 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic010G214950--Sobic003G200400 Sobic001G059150--Sobic010G214950 Sobic001G195400 Sobic001G195400 Sobic001G059150--Sobic001G195400 Sobic001G059150--Sobic001G234733 Sobic001G059150--Sobic001G150901 Sobic001G059150--Sobic005G146900 Sobic001G059150--Sobic007G223250 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G059150--Sobic004G198701 Sobic001G059150--Sobic002G288700 Sobic001G059150--Sobic003G200400 Sobic001G150901--Sobic007G011100 Sobic001G150901--Sobic010G214950 Sobic001G150901--Sobic002G288700 Sobic001G150901--Sobic005G146900 Sobic001G150901--Sobic001G222150 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic001G150901--Sobic003G159101 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic001G150901--Sobic005G036450 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G150901--Sobic006G123800 Sobic001G150901--Sobic002G423901 Sobic007G011100--Sobic001G150901 Sobic007G011100--Sobic001G222150 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic007G011100--Sobic002G220400 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic007G011100--Sobic004G073300 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic007G011100--Sobic009G058900 Sobic007G011100--Sobic010G214950 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic007G011100--Sobic001G039750 Sobic001G524150 Sobic001G524150 Sobic007G011100--Sobic001G524150 Sobic010G186900 Sobic010G186900 Sobic007G011100--Sobic010G186900 Sobic001G222150--Sobic007G011100 Sobic001G222150--Sobic002G220400 Sobic010G058600 Sobic010G058600 Sobic001G222150--Sobic010G058600 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G222150--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G222150--Sobic004G019550 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic001G222150--Sobic006G122000 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic001G222150--Sobic003G344300 Sobic001G222150--Sobic001G150901 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G222150--Sobic003G286450 Sobic006G145650--Sobic007G011100 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic006G145650--Sobic003G159300 Sobic006G145650--Sobic001G222150 Sobic006G145650--Sobic002G220400 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G145650--Sobic008G157700 Sobic006G145650--Sobic001G150901 Sobic006G145650--Sobic010G214950 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic006G145650--Sobic006G192600 Sobic006G145650--Sobic004G013900 Sobic002G423901--Sobic002G288700 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic002G423901--Sobic001G472050 Sobic002G423901--Sobic007G223250 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic002G423901--Sobic010G008433 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G423901--Sobic004G087000 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic002G423901--Sobic005G093901 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic002G423901--Sobic003G354050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic002G423901--Sobic007G109200 Sobic002G423901--Sobic001G234733 Sobic007G223250--Sobic002G288700 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic007G223250--Sobic002G014900 Sobic007G223250--Sobic004G087000 Sobic007G223250--Sobic006G123800 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic007G223250--Sobic001G266000 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic007G223250--Sobic002G150032 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G223250--Sobic003G172900 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic007G109200 Sobic002G288700--Sobic007G223250 Sobic002G288700--Sobic006G123800 Sobic002G288700--Sobic004G087000 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic002G288700--Sobic003G173266 Sobic002G288700--Sobic001G266000 Sobic002G288700--Sobic002G014900 Sobic002G288700--Sobic007G109200 Sobic002G288700--Sobic003G172900 Sobic002G288700--Sobic004G251400
Octagon: transcription factors


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