Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G288500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5X6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G017266 - -
2 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G004750 - -
4 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
5 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
7 Sobic.003G128575 - -
8 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
9 Sobic.002G322101 - -
10 Sobic.006G020350 - -
11 Sobic.005G183450 - -
12 Sobic.003G255850 - -
13 Sobic.006G147350 - -
14 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
15 Sobic.003G119750 - -
16 Sobic.001G249900 - -
17 Sobic.006G093550 - -
18 Sobic.007G149750 - -
19 Sobic.006G143800 - -
20 Sobic.003G354166 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G288500 Sobic003G288500 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G288500--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G288500--Sobic005G093600 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic003G288500--Sobic007G004750 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G288500--Sobic001G293900 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G288500--Sobic008G157700 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic003G288500--Sobic010G173600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G288500--Sobic003G128575 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic003G288500--Sobic006G124850 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic003G288500--Sobic002G322101 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic007G004750--Sobic001G293900 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic007G004750--Sobic003G119750 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic007G004750--Sobic010G132200 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic007G004750--Sobic003G168800 Sobic003G354166 Sobic003G354166 Sobic007G004750--Sobic003G354166 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic007G004750--Sobic003G344300 Sobic007G004750--Sobic008G157700 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic007G004750--Sobic003G423400 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic007G004750--Sobic003G169400 Sobic001G293900--Sobic003G119750 Sobic001G293900--Sobic010G132200 Sobic001G293900--Sobic003G169400 Sobic001G293900--Sobic003G168800 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic001G293900--Sobic003G172850 Sobic001G293900--Sobic003G423400 Sobic001G293900--Sobic006G124850 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G293900--Sobic006G192600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic001G293900--Sobic003G168500 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic010G173600--Sobic005G093600 Sobic010G173600--Sobic003G128575 Sobic010G173600--Sobic006G147350 Sobic010G173600--Sobic006G017266 Sobic010G173600--Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic003G255850 Sobic010G173600--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G183450 Sobic010G173600--Sobic002G322101 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic006G124850--Sobic002G149966 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic006G124850--Sobic003G290050 Sobic006G124850--Sobic003G169400 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G150032 Sobic006G124850--Sobic003G128575 Sobic006G124850--Sobic006G017266 Sobic006G124850--Sobic005G093600 Sobic006G124850--Sobic010G173600 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic007G149750 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic010G173600 Sobic002G322101--Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic006G147350 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic002G322101--Sobic001G249900 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic002G322101--Sobic002G397700 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic002G322101--Sobic010G107901
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.