Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G259300.1
Synonym JAZ1, TIFY10A, JAZ, Sb01g023290
Functional annotation tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN (PubMedID : 25711704)
zinc-finger protein, putative, expressed
UniProt C5WN74
Pfam PF09425 PF06200
Panther DB PTHR33077 PTHR33077:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19180 : jasmonate-zim-domain protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42370.1 : zinc-finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007058 , Zm00025a017874
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G259300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G323000 - -
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19 Sobic.001G326000 expressed protein -
20 Sobic.009G086800 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic001G259300--Sobic003G323000 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic001G259300--Sobic003G350900 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic001G259300--Sobic005G188000 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic001G259300--Sobic009G061800 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic001G259300--Sobic008G013100 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic001G259300--Sobic003G105600 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic001G259300--Sobic009G022700 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic001G259300--Sobic009G186400 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic001G259300--Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic008G013100 Sobic003G323000--Sobic003G105600 Sobic003G323000--Sobic003G350900 Sobic003G323000--Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic009G022700 Sobic003G323000--Sobic009G186400 Sobic003G323000--Sobic008G064000 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic003G323000--Sobic006G059900 Sobic003G350900--Sobic005G188000 Sobic003G350900--Sobic008G064000 Sobic003G350900--Sobic009G061800 Sobic003G350900--Sobic001G259300 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic003G350900--Sobic002G088000 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic003G350900--Sobic003G156100 Sobic003G350900--Sobic003G323000 Sobic003G350900--Sobic003G105600 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic003G350900--Sobic010G034900 Sobic005G188000--Sobic003G350900 Sobic005G188000--Sobic002G088000 Sobic005G188000--Sobic008G064000 Sobic005G188000--Sobic003G156100 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic005G188000--Sobic004G085100 Sobic004G116200 Sobic004G116200 Sobic005G188000--Sobic004G116200 Sobic005G188000--Sobic001G259300 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic005G188000--Sobic007G083300 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic005G188000--Sobic001G362900 Sobic009G061800--Sobic003G350900 Sobic009G061800--Sobic005G188000 Sobic009G061800--Sobic001G259300 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic009G061800--Sobic009G086800 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic009G061800--Sobic002G291132 Sobic009G061800--Sobic003G323000 Sobic009G061800--Sobic002G088000 Sobic009G061800--Sobic004G116200 Sobic009G061800--Sobic009G022700 Sobic008G013100--Sobic003G105600 Sobic008G013100--Sobic006G059900 Sobic008G013100--Sobic009G022700 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic008G013100--Sobic001G326000 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic008G013100--Sobic003G438700 Sobic008G013100--Sobic009G186400 Sobic008G013100--Sobic003G323000 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic008G013100--Sobic004G313800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic008G013100--Sobic005G187100 Sobic003G105600--Sobic009G186400 Sobic003G105600--Sobic001G326000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic008G013100 Sobic003G105600--Sobic009G022700 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic003G105600--Sobic007G156300 Sobic003G105600--Sobic006G059900 SobicK043500 SobicK043500 Sobic003G105600--SobicK043500 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic003G105600--Sobic005G112066 Sobic009G022700--Sobic003G105600 Sobic009G022700--Sobic008G013100 Sobic009G022700--Sobic009G186400 Sobic009G022700--Sobic001G326000 Sobic009G022700--Sobic006G059900 Sobic009G022700--Sobic002G077500 Sobic009G022700--Sobic003G438700 Sobic009G022700--Sobic004G313800 Sobic009G022700--Sobic003G350900 Sobic009G186400--Sobic002G077500 Sobic009G186400--SobicK043500 Sobic009G186400--Sobic003G105600 Sobic009G186400--Sobic001G326000 Sobic009G186400--Sobic007G083300 Sobic009G186400--Sobic005G112066 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic009G186400--Sobic007G049400 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic009G186400--Sobic007G070700 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic009G186400--Sobic002G077600 Sobic008G064000--Sobic010G034900 Sobic008G064000--Sobic007G083300 Sobic008G064000--Sobic003G156100 Sobic008G064000--Sobic007G070700 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic008G064000--Sobic003G247700 Sobic008G064000--SobicK043500 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic008G064000--Sobic002G211700 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic008G064000--Sobic001G535900 Sobic008G064000--Sobic005G188000
Octagon: transcription factors


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