Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G293633.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S866
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G529100 expressed protein K15203: general transcription factor 3C polypeptide 6
2 Sobic.003G242400 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.003G399101 - -
4 Sobic.001G452800 - -
5 Sobic.001G156000 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
6 Sobic.003G061850 - -
7 Sobic.001G002650 - -
8 Sobic.006G011450 - -
9 Sobic.010G041301 - -
10 Sobic.009G116832 - -
11 Sobic.008G170900 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G153900 expressed protein -
13 Sobic.001G273875 - -
14 Sobic.001G490350 - -
15 Sobic.003G329100 DUF617 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G025066 - -
17 Sobic.002G045900 - -
18 Sobic.008G068700 DUF1336 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G230100 - -
20 Sobic.006G089200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G293633 Sobic001G293633 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic001G293633--Sobic001G529100 Sobic003G242400 Sobic003G242400 Sobic001G293633--Sobic003G242400 Sobic003G399101 Sobic003G399101 Sobic001G293633--Sobic003G399101 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic001G293633--Sobic001G452800 Sobic001G156000 Sobic001G156000 Sobic001G293633--Sobic001G156000 Sobic003G061850 Sobic003G061850 Sobic001G293633--Sobic003G061850 Sobic001G002650 Sobic001G002650 Sobic001G293633--Sobic001G002650 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic001G293633--Sobic006G011450 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic001G293633--Sobic010G041301 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic001G529100--Sobic001G273875 Sobic001G529100--Sobic006G011450 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic001G529100--Sobic004G201000 Sobic001G529100--Sobic001G293633 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic001G529100--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic001G529100--Sobic004G065950 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic001G529100--Sobic003G125751 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic001G529100--Sobic004G290850 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic001G529100--Sobic008G068700 Sobic003G242400--Sobic010G041301 Sobic009G116832 Sobic009G116832 Sobic003G242400--Sobic009G116832 Sobic003G242400--Sobic003G399101 Sobic003G329100 Sobic003G329100 Sobic003G242400--Sobic003G329100 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic003G242400--Sobic004G007550 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic003G242400--Sobic006G244900 Sobic004G217400 Sobic004G217400 Sobic003G242400--Sobic004G217400 Sobic008G170900 Sobic008G170900 Sobic003G242400--Sobic008G170900 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic003G242400--Sobic007G151900 Sobic003G399101--Sobic008G170900 Sobic003G399101--Sobic003G242400 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G399101--Sobic001G018700 Sobic001G452800--Sobic009G116832 Sobic001G452800--Sobic010G041301 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic001G452800--Sobic010G230100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G452800--Sobic009G206900 Sobic001G452800--Sobic003G242400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic001G452800--Sobic006G090450 Sobic001G452800--Sobic003G329100 Sobic001G452800--Sobic008G170900 Sobic005G153900 Sobic005G153900 Sobic001G452800--Sobic005G153900 Sobic001G156000--Sobic001G293633 Sobic001G156000--Sobic001G529100 Sobic001G156000--Sobic003G242400 Sobic001G156000--Sobic003G061850 Sobic001G156000--Sobic003G399101 Sobic001G156000--Sobic001G452800 Sobic002G045900 Sobic002G045900 Sobic001G156000--Sobic002G045900 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic001G156000--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic001G156000--Sobic004G056350 Sobic004G161850 Sobic004G161850 Sobic003G061850--Sobic004G161850 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic003G061850--Sobic009G248200 Sobic003G061850--Sobic001G293633 Sobic005G019000 Sobic005G019000 Sobic003G061850--Sobic005G019000 Sobic003G061850--Sobic001G002650 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic003G061850--Sobic002G025200 Sobic003G061850--Sobic003G242400 Sobic003G061850--Sobic001G529100 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic003G061850--Sobic001G509901 Sobic001G002650--Sobic001G293633 Sobic001G002650--Sobic003G061850 Sobic001G490350 Sobic001G490350 Sobic001G002650--Sobic001G490350 Sobic001G002650--Sobic001G452800 Sobic001G002650--Sobic002G025200 Sobic001G002650--Sobic001G509901 Sobic001G002650--Sobic003G242400 Sobic001G002650--Sobic010G041301 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic001G002650--Sobic005G166200 Sobic006G011450--Sobic001G273875 Sobic006G011450--Sobic004G201000 Sobic006G011450--Sobic001G529100 Sobic006G011450--Sobic010G155401 Sobic006G011450--Sobic004G065950 Sobic006G011450--Sobic004G290850 Sobic006G011450--Sobic003G125751 Sobic010G023650 Sobic010G023650 Sobic006G011450--Sobic010G023650 Sobic006G011450--Sobic008G068700 Sobic010G041301--Sobic009G116832 Sobic010G041301--Sobic003G242400 Sobic010G041301--Sobic003G329100 Sobic010G041301--Sobic004G007550 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic010G041301--Sobic004G300400 Sobic010G041301--Sobic007G151900 Sobic010G041301--Sobic010G230100 Sobic010G041301--Sobic006G244900 Sobic010G041301--Sobic001G452800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.