Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G529100.1
Synonym Sb01g049230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X0Y0
Pfam PF10419
Panther DB PTHR21860 PTHR21860:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15203; general transcription factor 3C polypeptide 6
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15420 : Transcription factor TFIIIC, tau55-related protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000279 , Zm00025a053513
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G084300 , TraesCSU02G084300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G273875 - -
2 Sobic.006G011450 - -
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17 Sobic.007G220033 - -
18 Sobic.001G121500 - -
19 Sobic.010G165400 - -
20 Sobic.002G427600 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic001G529100--Sobic001G273875 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic001G529100--Sobic006G011450 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic001G529100--Sobic004G201000 Sobic001G293633 Sobic001G293633 Sobic001G529100--Sobic001G293633 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic001G529100--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic001G529100--Sobic004G065950 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic001G529100--Sobic003G125751 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic001G529100--Sobic004G290850 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic001G529100--Sobic008G068700 Sobic001G273875--Sobic004G201000 Sobic001G273875--Sobic010G155401 Sobic001G273875--Sobic004G065950 Sobic001G273875--Sobic006G011450 Sobic001G273875--Sobic004G290850 Sobic001G273875--Sobic003G125751 Sobic001G273875--Sobic001G529100 Sobic010G023650 Sobic010G023650 Sobic001G273875--Sobic010G023650 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic001G273875--Sobic007G220033 Sobic006G011450--Sobic001G273875 Sobic006G011450--Sobic004G201000 Sobic006G011450--Sobic001G529100 Sobic006G011450--Sobic010G155401 Sobic006G011450--Sobic004G065950 Sobic006G011450--Sobic004G290850 Sobic006G011450--Sobic003G125751 Sobic006G011450--Sobic010G023650 Sobic006G011450--Sobic008G068700 Sobic004G201000--Sobic010G155401 Sobic004G201000--Sobic004G065950 Sobic004G201000--Sobic001G273875 Sobic004G201000--Sobic003G125751 Sobic004G201000--Sobic004G290850 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic004G201000--Sobic002G427600 Sobic004G201000--Sobic006G011450 Sobic004G201000--Sobic007G220033 Sobic004G201000--Sobic010G023650 Sobic001G293633--Sobic001G529100 Sobic003G242400 Sobic003G242400 Sobic001G293633--Sobic003G242400 Sobic003G399101 Sobic003G399101 Sobic001G293633--Sobic003G399101 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic001G293633--Sobic001G452800 Sobic001G156000 Sobic001G156000 Sobic001G293633--Sobic001G156000 Sobic003G061850 Sobic003G061850 Sobic001G293633--Sobic003G061850 Sobic001G002650 Sobic001G002650 Sobic001G293633--Sobic001G002650 Sobic001G293633--Sobic006G011450 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic001G293633--Sobic010G041301 Sobic010G155401--Sobic004G201000 Sobic010G155401--Sobic004G065950 Sobic010G155401--Sobic001G273875 Sobic010G155401--Sobic003G125751 Sobic010G155401--Sobic004G290850 Sobic010G155401--Sobic002G427600 Sobic010G155401--Sobic006G011450 Sobic010G155401--Sobic007G220033 Sobic010G155401--Sobic010G023650 Sobic004G065950--Sobic004G201000 Sobic004G065950--Sobic010G155401 Sobic004G065950--Sobic001G273875 Sobic004G065950--Sobic003G125751 Sobic004G065950--Sobic004G290850 Sobic004G065950--Sobic002G427600 Sobic004G065950--Sobic006G011450 Sobic004G065950--Sobic007G220033 Sobic004G065950--Sobic010G023650 Sobic003G125751--Sobic004G201000 Sobic003G125751--Sobic010G155401 Sobic003G125751--Sobic004G065950 Sobic003G125751--Sobic004G290850 Sobic003G125751--Sobic001G273875 Sobic003G125751--Sobic002G427600 Sobic003G125751--Sobic007G220033 Sobic003G125751--Sobic006G011450 Sobic003G125751--Sobic010G023650 Sobic004G290850--Sobic004G201000 Sobic004G290850--Sobic010G155401 Sobic004G290850--Sobic004G065950 Sobic004G290850--Sobic003G125751 Sobic004G290850--Sobic001G273875 Sobic004G290850--Sobic002G427600 Sobic004G290850--Sobic006G011450 Sobic004G290850--Sobic007G220033 Sobic004G290850--Sobic010G023650 Sobic008G068700--Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G529100 Sobic008G068700--Sobic004G201000 Sobic008G068700--Sobic006G011450 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G155401 Sobic008G068700--Sobic004G065950 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic003G125751
Octagon: transcription factors


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