Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G068700.1
Synonym
Functional annotation DUF1336 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PC10
Pfam PF07059
Panther DB PTHR31558
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G29180 : Protein of unknown function (DUF1336)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38850.1 : DUF1336 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004330
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5A02G075300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G273875 - -
2 Sobic.001G529100 expressed protein K15203: general transcription factor 3C polypeptide 6
3 Sobic.004G201000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
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15 Sobic.010G094200 - -
16 Sobic.001G293633 - -
17 Sobic.003G061850 - -
18 Sobic.007G220033 - -
19 Sobic.004G088800 OsFBX390 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G427600 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G273875 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic008G068700--Sobic001G529100 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic008G068700--Sobic004G201000 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic008G068700--Sobic006G011450 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G276850 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic008G068700--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic008G068700--Sobic004G065950 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic001G038050 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic008G068700--Sobic003G125751 Sobic001G273875--Sobic004G201000 Sobic001G273875--Sobic010G155401 Sobic001G273875--Sobic004G065950 Sobic001G273875--Sobic006G011450 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic001G273875--Sobic004G290850 Sobic001G273875--Sobic003G125751 Sobic001G273875--Sobic001G529100 Sobic010G023650 Sobic010G023650 Sobic001G273875--Sobic010G023650 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic001G273875--Sobic007G220033 Sobic001G529100--Sobic001G273875 Sobic001G529100--Sobic006G011450 Sobic001G529100--Sobic004G201000 Sobic001G293633 Sobic001G293633 Sobic001G529100--Sobic001G293633 Sobic001G529100--Sobic010G155401 Sobic001G529100--Sobic004G065950 Sobic001G529100--Sobic003G125751 Sobic001G529100--Sobic004G290850 Sobic001G529100--Sobic008G068700 Sobic004G201000--Sobic010G155401 Sobic004G201000--Sobic004G065950 Sobic004G201000--Sobic001G273875 Sobic004G201000--Sobic003G125751 Sobic004G201000--Sobic004G290850 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic004G201000--Sobic002G427600 Sobic004G201000--Sobic006G011450 Sobic004G201000--Sobic007G220033 Sobic004G201000--Sobic010G023650 Sobic006G011450--Sobic001G273875 Sobic006G011450--Sobic004G201000 Sobic006G011450--Sobic001G529100 Sobic006G011450--Sobic010G155401 Sobic006G011450--Sobic004G065950 Sobic006G011450--Sobic004G290850 Sobic006G011450--Sobic003G125751 Sobic006G011450--Sobic010G023650 Sobic006G011450--Sobic008G068700 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic010G276850--Sobic010G091250 Sobic010G094200 Sobic010G094200 Sobic010G276850--Sobic010G094200 Sobic010G276850--Sobic001G038050 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic010G276850--Sobic004G073300 Sobic003G031001 Sobic003G031001 Sobic010G276850--Sobic003G031001 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic010G276850--Sobic002G314100 Sobic010G276850--Sobic008G068700 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic010G276850--Sobic004G193100 Sobic003G388601 Sobic003G388601 Sobic010G276850--Sobic003G388601 Sobic010G155401--Sobic004G201000 Sobic010G155401--Sobic004G065950 Sobic010G155401--Sobic001G273875 Sobic010G155401--Sobic003G125751 Sobic010G155401--Sobic004G290850 Sobic010G155401--Sobic002G427600 Sobic010G155401--Sobic006G011450 Sobic010G155401--Sobic007G220033 Sobic010G155401--Sobic010G023650 Sobic004G065950--Sobic004G201000 Sobic004G065950--Sobic010G155401 Sobic004G065950--Sobic001G273875 Sobic004G065950--Sobic003G125751 Sobic004G065950--Sobic004G290850 Sobic004G065950--Sobic002G427600 Sobic004G065950--Sobic006G011450 Sobic004G065950--Sobic007G220033 Sobic004G065950--Sobic010G023650 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic001G038050--Sobic002G025200 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic001G038050--Sobic002G419550 Sobic001G038050--Sobic010G276850 Sobic004G088800 Sobic004G088800 Sobic001G038050--Sobic004G088800 Sobic001G038050--Sobic010G094200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic001G038050--Sobic005G166200 Sobic001G038050--Sobic008G068700 Sobic001G038050--Sobic003G388601 Sobic001G038050--Sobic001G273875 Sobic003G125751--Sobic004G201000 Sobic003G125751--Sobic010G155401 Sobic003G125751--Sobic004G065950 Sobic003G125751--Sobic004G290850 Sobic003G125751--Sobic001G273875 Sobic003G125751--Sobic002G427600 Sobic003G125751--Sobic007G220033 Sobic003G125751--Sobic006G011450 Sobic003G125751--Sobic010G023650
Octagon: transcription factors


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