Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G025000.2
Synonym Sb08g002180
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R4G0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G068700 DUF1336 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
3 Sobic.004G269300 - -
4 Sobic.009G106601 - -
5 Sobic.002G033550 - -
6 Sobic.003G143600 pectinesterase, putative, expressed -
7 Sobic.001G094100 - -
8 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
9 Sobic.001G529100 expressed protein K15203: general transcription factor 3C polypeptide 6
10 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.001G324300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G199100 - -
13 Sobic.007G024400 ribosome, putative, expressed -
14 Sobic.001G293633 - -
15 Sobic.001G273875 - -
16 Sobic.001G156000 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.006G011450 - -
18 Sobic.003G125751 - -
19 Sobic.004G252250 - -
20 Sobic.004G201000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G025000 Sobic008G025000 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic008G025000--Sobic008G068700 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic008G025000--Sobic002G000900 Sobic004G269300 Sobic004G269300 Sobic008G025000--Sobic004G269300 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic008G025000--Sobic009G106601 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic008G025000--Sobic002G033550 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic008G025000--Sobic003G143600 Sobic001G094100 Sobic001G094100 Sobic008G025000--Sobic001G094100 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic008G025000--Sobic002G109700 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic008G025000--Sobic001G529100 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G529100 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic008G068700--Sobic004G201000 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic008G068700--Sobic006G011450 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G276850 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic008G068700--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic008G068700--Sobic004G065950 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic001G038050 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic008G068700--Sobic003G125751 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic002G000900--Sobic007G050650 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G000900--Sobic001G324300 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic002G000900--Sobic005G049100 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic002G000900--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic002G109700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic008G025000 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic002G000900--Sobic004G358800 Sobic010G238000 Sobic010G238000 Sobic004G269300--Sobic010G238000 Sobic004G269300--Sobic008G025000 Sobic004G269300--Sobic002G033550 Sobic004G269300--Sobic008G068700 Sobic004G269300--Sobic002G000900 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic004G269300--Sobic002G245700 Sobic004G269300--Sobic009G106601 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic004G269300--Sobic004G176950 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic004G269300--Sobic001G472050 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic009G106601--Sobic001G137900 Sobic009G106601--Sobic002G033550 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic009G106601--Sobic004G199100 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic002G109700 Sobic009G106601--Sobic002G000900 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic009G106601--Sobic008G142450 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic003G143600 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic002G033550--Sobic005G019250 Sobic003G143600--Sobic004G199100 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic003G143600--Sobic005G166200 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic003G143600--Sobic008G123700 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G143600--Sobic004G061100 Sobic002G198900 Sobic002G198900 Sobic003G143600--Sobic002G198900 Sobic003G143600--Sobic001G094100 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic003G143600--Sobic001G509901 Sobic003G143600--Sobic001G137900 Sobic003G143600--Sobic002G033550 Sobic001G094100--Sobic003G143600 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic001G094100--Sobic003G105200 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G094100--Sobic002G142400 Sobic001G094100--Sobic002G109700 Sobic001G094100--Sobic008G025000 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G094100--Sobic004G291300 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic001G094100--Sobic006G239200 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic001G094100--Sobic003G333300 Sobic001G094100--Sobic004G061100 Sobic002G109700--Sobic008G142450 Sobic002G109700--Sobic001G324300 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic002G109700--Sobic009G206900 Sobic002G109700--Sobic008G123700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic001G137900 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic002G109700--Sobic004G079400 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic004G252250 Sobic001G529100--Sobic001G273875 Sobic001G529100--Sobic006G011450 Sobic001G529100--Sobic004G201000 Sobic001G293633 Sobic001G293633 Sobic001G529100--Sobic001G293633 Sobic001G529100--Sobic010G155401 Sobic001G529100--Sobic004G065950 Sobic001G529100--Sobic003G125751 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic001G529100--Sobic004G290850 Sobic001G529100--Sobic008G068700
Octagon: transcription factors


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