Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G324300.1
Synonym Sb01g031420
Functional annotation plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S8R3
Pfam PF03140
Panther DB PTHR31549 PTHR31549:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02645 : Plant protein of unknown function (DUF247)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g39520.1 : plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
2 Sobic.009G056950 - -
3 Sobic.009G206900 - -
4 Sobic.008G142450 - -
5 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
6 Sobic.004G352750 - -
7 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
8 Sobic.005G197900 expressed protein -
9 Sobic.007G050650 - -
10 Sobic.003G031300 - -
11 Sobic.003G185800 - -
12 Sobic.010G266400 - -
13 Sobic.004G358800 protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.006G113301 - -
15 Sobic.003G059450 - -
16 Sobic.002G199300 - -
17 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
18 Sobic.001G257600 - -
19 Sobic.008G123700 expressed protein -
20 Sobic.002G334700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic001G324300--Sobic002G109700 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic001G324300--Sobic009G056950 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G324300--Sobic009G206900 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic001G324300--Sobic008G142450 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic001G324300--Sobic002G000900 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic001G324300--Sobic004G352750 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic001G324300--Sobic005G049100 Sobic005G197900 Sobic005G197900 Sobic001G324300--Sobic005G197900 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic001G324300--Sobic007G050650 Sobic002G109700--Sobic008G142450 Sobic002G109700--Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic009G206900 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic002G109700--Sobic008G123700 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G109700--Sobic003G031300 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic002G109700--Sobic001G137900 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic002G109700--Sobic004G079400 Sobic002G109700--Sobic009G056950 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic002G109700--Sobic004G252250 Sobic009G056950--Sobic001G324300 Sobic009G056950--Sobic005G197900 Sobic009G056950--Sobic004G352750 Sobic009G056950--Sobic002G109700 Sobic002G326300 Sobic002G326300 Sobic009G056950--Sobic002G326300 Sobic003G185800 Sobic003G185800 Sobic009G056950--Sobic003G185800 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic009G056950--Sobic001G257600 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic009G056950--Sobic003G059450 Sobic009G056950--Sobic003G031300 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic009G206900--Sobic006G090450 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic009G206900--Sobic001G452800 Sobic009G206900--Sobic008G142450 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic009G206900--Sobic010G227600 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic009G206900--Sobic010G041301 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic009G206900--Sobic010G230100 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic009G206900--Sobic001G372400 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic009G206900--Sobic004G233100 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic009G206900--Sobic003G108050 Sobic008G142450--Sobic009G206900 Sobic008G142450--Sobic004G252250 Sobic008G142450--Sobic006G090450 Sobic008G142450--Sobic008G123700 Sobic008G142450--Sobic002G109700 Sobic008G142450--Sobic001G452800 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic008G142450--Sobic002G071201 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic008G142450--Sobic004G199100 Sobic008G142450--Sobic010G227600 Sobic002G000900--Sobic007G050650 Sobic002G000900--Sobic001G324300 Sobic002G000900--Sobic005G049100 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic002G000900--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic002G109700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic010G266400 Sobic008G025000 Sobic008G025000 Sobic002G000900--Sobic008G025000 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic002G000900--Sobic004G358800 Sobic004G352750--Sobic003G031300 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic003G311300 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic004G352750--Sobic001G208133 Sobic004G352750--Sobic004G079400 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic004G352750--Sobic001G174200 Sobic004G352750--Sobic001G257600 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G352750--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic004G352750--Sobic009G011050 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G352750--Sobic003G030100 Sobic005G049100--Sobic004G358800 Sobic003G406180 Sobic003G406180 Sobic005G049100--Sobic003G406180 Sobic004G185300 Sobic004G185300 Sobic005G049100--Sobic004G185300 Sobic005G049100--Sobic007G050750 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic001G112550 Sobic005G049100--Sobic007G050650 Sobic006G087600 Sobic006G087600 Sobic005G049100--Sobic006G087600 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic005G049100--Sobic003G148950 Sobic005G197900--Sobic003G185800 Sobic001G277700 Sobic001G277700 Sobic005G197900--Sobic001G277700 Sobic005G148300 Sobic005G148300 Sobic005G197900--Sobic005G148300 Sobic007G182700 Sobic007G182700 Sobic005G197900--Sobic007G182700 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic005G197900--Sobic001G519500 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic005G197900--Sobic006G007700 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic005G197900--Sobic007G043050 Sobic005G197900--Sobic009G056950 Sobic001G453250 Sobic001G453250 Sobic005G197900--Sobic001G453250 Sobic007G050650--Sobic010G266400 Sobic007G050650--Sobic006G113301 Sobic007G050650--Sobic001G112550 Sobic007G050650--Sobic007G050750 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic007G050650--Sobic001G443400 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic007G050650--Sobic002G199300 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic007G050650--Sobic005G192350 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic007G050650--Sobic006G250350 Sobic007G050650--Sobic005G049100
Octagon: transcription factors


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