Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G269300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRR8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G238000 - -
2 Sobic.008G025000 expressed protein -
3 Sobic.002G033550 - -
4 Sobic.008G068700 DUF1336 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
6 Sobic.002G245700 slowmo homolog, putative, expressed -
7 Sobic.009G106601 - -
8 Sobic.004G176950 - -
9 Sobic.001G472050 - -
10 Sobic.001G217850 - -
11 Sobic.004G169401 - -
12 Sobic.009G170050 - -
13 Sobic.002G423901 - -
14 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.003G031001 - -
16 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
17 Sobic.004G290850 - -
18 Sobic.004G065950 - -
19 Sobic.010G276850 - -
20 Sobic.004G201000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G269300 Sobic004G269300 Sobic010G238000 Sobic010G238000 Sobic004G269300--Sobic010G238000 Sobic008G025000 Sobic008G025000 Sobic004G269300--Sobic008G025000 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G269300--Sobic002G033550 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic004G269300--Sobic008G068700 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic004G269300--Sobic002G000900 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic004G269300--Sobic002G245700 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic004G269300--Sobic009G106601 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic004G269300--Sobic004G176950 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic004G269300--Sobic001G472050 Sobic010G238000--Sobic001G472050 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic010G238000--Sobic001G489550 Sobic010G238000--Sobic004G269300 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic010G238000--Sobic002G423901 Sobic010G238000--Sobic002G245700 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic010G238000--Sobic010G102700 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic010G238000--Sobic004G169401 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic010G238000--Sobic010G008433 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic010G238000--Sobic007G199901 Sobic008G025000--Sobic008G068700 Sobic008G025000--Sobic002G000900 Sobic008G025000--Sobic004G269300 Sobic008G025000--Sobic009G106601 Sobic008G025000--Sobic002G033550 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic008G025000--Sobic003G143600 Sobic001G094100 Sobic001G094100 Sobic008G025000--Sobic001G094100 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic008G025000--Sobic002G109700 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic008G025000--Sobic001G529100 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic002G033550--Sobic005G019250 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G529100 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic008G068700--Sobic004G201000 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic008G068700--Sobic006G011450 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G276850 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic008G068700--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic008G068700--Sobic004G065950 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic001G038050 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic008G068700--Sobic003G125751 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic002G000900--Sobic007G050650 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G000900--Sobic001G324300 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic002G000900--Sobic005G049100 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic002G000900--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic002G109700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic008G025000 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic002G000900--Sobic004G358800 Sobic002G245700--Sobic007G199901 Sobic002G245700--Sobic004G169401 Sobic002G245700--Sobic001G413300 Sobic002G245700--Sobic003G208200 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic002G245700--Sobic004G320900 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic002G245700--Sobic002G413100 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic002G245700--Sobic003G053100 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic002G245700--Sobic003G117850 Sobic002G245700--Sobic004G176950 Sobic009G106601--Sobic001G137900 Sobic009G106601--Sobic002G033550 Sobic009G106601--Sobic004G199100 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic002G109700 Sobic009G106601--Sobic002G000900 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic009G106601--Sobic008G142450 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic003G143600 Sobic004G176950--Sobic002G245700 Sobic004G176950--Sobic002G413100 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic004G176950--Sobic001G148000 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic004G176950--Sobic010G268500 Sobic004G176950--Sobic003G053100 Sobic004G176950--Sobic001G413300 Sobic004G176950--Sobic003G208200 Sobic004G176950--Sobic007G199901 Sobic004G176950--Sobic003G117850 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic001G472050--Sobic005G093901 Sobic001G472050--Sobic002G423901 Sobic001G472050--Sobic001G489550 Sobic001G472050--Sobic010G008433 Sobic001G472050--Sobic002G413100 Sobic001G472050--Sobic003G117850 Sobic001G472050--Sobic004G320900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic001G472050--Sobic004G087000 Sobic001G472050--Sobic002G245700
Octagon: transcription factors


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