Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G245700.2
Synonym Sb02g028235
Functional annotation slowmo homolog, putative, expressed
UniProt A0A1W0W5J6
Pfam PF04707
Panther DB PTHR11158 PTHR11158:SF28
NCBI CDD KOG3336; Predicted member of the intramitochondrial sorting protein family
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13070 : MSF1-like family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31190.1 : slowmo homolog, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047435
Brachypodium KQK01039 , KQJ90734
Barley HORVU6Hr1G070680.1 , HORVU6Hr1G070680.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G199901 - -
2 Sobic.004G169401 - -
3 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
4 Sobic.003G208200 - -
5 Sobic.004G320900 - -
6 Sobic.002G413100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G053100 - -
8 Sobic.003G117850 - -
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11 Sobic.005G093901 - -
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14 Sobic.001G472050 - -
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17 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.002G033550 - -
19 Sobic.003G161900 - -
20 Sobic.003G172600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic002G245700--Sobic007G199901 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic002G245700--Sobic004G169401 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G245700--Sobic001G413300 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G245700--Sobic003G208200 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic002G245700--Sobic004G320900 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic002G245700--Sobic002G413100 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic002G245700--Sobic003G053100 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic002G245700--Sobic003G117850 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic002G245700--Sobic004G176950 Sobic007G199901--Sobic002G245700 Sobic007G199901--Sobic003G053100 Sobic003G351501 Sobic003G351501 Sobic007G199901--Sobic003G351501 Sobic007G199901--Sobic001G413300 Sobic007G199901--Sobic004G320900 Sobic007G199901--Sobic003G208200 Sobic003G172800 Sobic003G172800 Sobic007G199901--Sobic003G172800 Sobic007G199901--Sobic003G117850 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G199901--Sobic010G039150 Sobic004G169401--Sobic002G245700 Sobic004G169401--Sobic007G199901 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic004G169401--Sobic007G023000 Sobic004G169401--Sobic001G413300 Sobic004G169401--Sobic003G208200 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G169401--Sobic008G129500 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic004G169401--Sobic001G224500 Sobic004G169401--Sobic003G351501 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic004G169401--Sobic001G373850 Sobic001G413300--Sobic003G208200 Sobic001G413300--Sobic003G351501 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G413300--Sobic003G169700 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic001G413300--Sobic007G085400 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic001G413300--Sobic002G033550 Sobic001G413300--Sobic001G224500 Sobic001G413300--Sobic001G373850 Sobic001G413300--Sobic002G245700 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G413300--Sobic003G161900 Sobic003G208200--Sobic001G373850 Sobic003G208200--Sobic003G161900 Sobic003G208200--Sobic003G351501 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G208200--Sobic001G261444 Sobic003G208200--Sobic001G413300 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G208200--Sobic001G202450 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic003G208200--Sobic001G093400 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic003G208200--Sobic008G100201 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic003G208200--Sobic004G115100 Sobic004G320900--Sobic003G117850 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic004G320900--Sobic007G207100 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G320900--Sobic002G270733 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic004G320900--Sobic001G489550 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic004G320900--Sobic002G148166 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic004G320900--Sobic005G093901 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic004G320900--Sobic009G148950 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic002G150200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic004G320900--Sobic003G172600 Sobic002G413100--Sobic005G093901 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic002G413100--Sobic010G268500 Sobic002G413100--Sobic003G117850 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic002G413100--Sobic001G022700 Sobic002G413100--Sobic009G148950 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G413100--Sobic003G172701 Sobic002G413100--Sobic002G270733 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic002G413100--Sobic006G057050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic002G413100--Sobic007G109200 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G053100--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic004G176950--Sobic002G245700 Sobic004G176950--Sobic002G413100 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic004G176950--Sobic001G148000 Sobic004G176950--Sobic010G268500 Sobic004G176950--Sobic003G053100 Sobic004G176950--Sobic001G413300 Sobic004G176950--Sobic003G208200 Sobic004G176950--Sobic007G199901 Sobic004G176950--Sobic003G117850
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