Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G199901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RBV4
Pfam PF00304
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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MaizeGDB (Corn) -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G245700 slowmo homolog, putative, expressed -
2 Sobic.003G053100 - -
3 Sobic.003G351501 - -
4 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
5 Sobic.004G320900 - -
6 Sobic.003G208200 - -
7 Sobic.003G172800 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
8 Sobic.003G117850 - -
9 Sobic.010G039150 - -
10 Sobic.004G169401 - -
11 Sobic.001G340100 - -
12 Sobic.003G159101 - -
13 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
14 Sobic.005G036450 - -
15 Sobic.001G471050 - -
16 Sobic.002G423901 - -
17 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
18 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
19 Sobic.002G348850 - -
20 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7


Gene co-expression network
sample Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic007G199901--Sobic002G245700 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic007G199901--Sobic003G053100 Sobic003G351501 Sobic003G351501 Sobic007G199901--Sobic003G351501 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic007G199901--Sobic001G413300 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic007G199901--Sobic004G320900 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic007G199901--Sobic003G208200 Sobic003G172800 Sobic003G172800 Sobic007G199901--Sobic003G172800 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic007G199901--Sobic003G117850 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G199901--Sobic010G039150 Sobic002G245700--Sobic007G199901 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic002G245700--Sobic004G169401 Sobic002G245700--Sobic001G413300 Sobic002G245700--Sobic003G208200 Sobic002G245700--Sobic004G320900 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic002G245700--Sobic002G413100 Sobic002G245700--Sobic003G053100 Sobic002G245700--Sobic003G117850 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic002G245700--Sobic004G176950 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G053100--Sobic001G230050 Sobic003G351501--Sobic003G208200 Sobic003G351501--Sobic001G413300 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G351501--Sobic004G134400 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic003G351501--Sobic003G169700 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic003G351501--Sobic001G093400 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G351501--Sobic009G079600 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G351501--Sobic004G274300 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic003G351501--Sobic007G085400 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic003G351501--Sobic009G260550 Sobic001G413300--Sobic003G208200 Sobic001G413300--Sobic003G351501 Sobic001G413300--Sobic003G169700 Sobic001G413300--Sobic007G085400 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic001G413300--Sobic002G033550 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic001G413300--Sobic001G224500 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G413300--Sobic001G373850 Sobic001G413300--Sobic002G245700 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G413300--Sobic003G161900 Sobic004G320900--Sobic003G117850 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic004G320900--Sobic007G207100 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G320900--Sobic002G270733 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic004G320900--Sobic001G489550 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic004G320900--Sobic002G148166 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic004G320900--Sobic005G093901 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic004G320900--Sobic009G148950 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic003G172600 Sobic003G208200--Sobic001G373850 Sobic003G208200--Sobic003G161900 Sobic003G208200--Sobic003G351501 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G208200--Sobic001G261444 Sobic003G208200--Sobic001G413300 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G208200--Sobic001G202450 Sobic003G208200--Sobic001G093400 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic003G208200--Sobic008G100201 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic003G208200--Sobic004G115100 Sobic003G172800--Sobic010G039150 Sobic001G506200 Sobic001G506200 Sobic003G172800--Sobic001G506200 Sobic003G172800--Sobic003G053100 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic003G172800--Sobic006G029850 Sobic003G172800--Sobic005G139900 Sobic003G172800--Sobic001G261444 Sobic003G172800--Sobic004G303433 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic003G172800--Sobic010G201332 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic003G172800--Sobic001G383350 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic010G039150--Sobic009G079600 Sobic010G039150--Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic004G274300 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic004G134400 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic010G039150--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic010G039150--Sobic003G260500 Sobic010G039150--Sobic004G115100 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic010G039150--Sobic001G323101
Octagon: transcription factors


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