Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G413100.1
Synonym Sb02g042570
Functional annotation DUF567 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5X4Y9
Pfam PF04525
Panther DB PTHR31087 PTHR31087:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14260 : Protein of unknown function (DUF567)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47540.1 : DUF567 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002408
Brachypodium KQK14699
Barley HORVU2Hr1G019720.2 , HORVU2Hr1G019720.1
Wheat TraesCS2B02G132800 , TraesCS2A02G113800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G093901 - -
2 Sobic.010G268500 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
3 Sobic.003G117850 - -
4 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.009G148950 - -
6 Sobic.003G172701 - -
7 Sobic.002G270733 - -
8 Sobic.006G057050 - -
9 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
10 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
11 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
12 Sobic.005G139750 - -
13 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
14 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
15 Sobic.003G172600 - -
16 Sobic.004G210400 expressed protein -
17 Sobic.006G124800 - -
18 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
19 Sobic.004G337850 - -
20 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I


Gene co-expression network
sample Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic002G413100--Sobic005G093901 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic002G413100--Sobic010G268500 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic002G413100--Sobic003G117850 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic002G413100--Sobic001G022700 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic002G413100--Sobic009G148950 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G413100--Sobic003G172701 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic002G413100--Sobic002G270733 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic002G413100--Sobic006G057050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic002G413100--Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic009G148950 Sobic005G093901--Sobic003G172701 Sobic005G093901--Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic002G270733 Sobic005G093901--Sobic003G117850 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic006G057050 Sobic005G093901--Sobic001G022700 Sobic010G268500--Sobic001G022700 Sobic010G268500--Sobic002G413100 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic010G268500--Sobic005G104900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic010G268500--Sobic005G139750 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic010G268500--Sobic003G161900 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic010G268500--Sobic004G077700 Sobic010G268500--Sobic005G093901 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic010G268500--Sobic007G145801 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic010G268500--Sobic003G173116 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic001G022700--Sobic005G139750 Sobic001G022700--Sobic004G077700 Sobic001G022700--Sobic003G173116 Sobic001G022700--Sobic007G145801 Sobic001G022700--Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic005G104900 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic001G230050 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G022700--Sobic009G174150 Sobic009G148950--Sobic002G270733 Sobic009G148950--Sobic003G172701 Sobic009G148950--Sobic009G123100 Sobic009G148950--Sobic006G057050 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic009G148950--Sobic005G110493 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic009G148950--Sobic003G172500 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic009G148950--Sobic004G210400 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G148950--Sobic004G087050 SobicK032300 SobicK032300 Sobic009G148950--SobicK032300 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic002G270733--Sobic009G148950 Sobic002G270733--Sobic003G172701 Sobic002G270733--Sobic004G210400 Sobic002G270733--Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic005G110493 Sobic002G270733--SobicK032300 Sobic002G270733--Sobic006G057050 Sobic002G270733--Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic002G148166 Sobic006G057050--Sobic003G172701 Sobic006G057050--Sobic009G123100 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic009G148950 Sobic006G057050--Sobic003G172500 Sobic006G057050--Sobic005G110493 Sobic006G057050--Sobic007G109200 Sobic006G057050--Sobic004G087050 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic006G057050--Sobic010G052866 Sobic007G109200--Sobic004G087000 Sobic007G109200--Sobic003G172701 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G109200--Sobic004G251400 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic002G148166 Sobic007G109200--Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic003G169300 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic005G110493
Octagon: transcription factors


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