Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G472050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SB08
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G093901 - -
2 Sobic.002G423901 - -
3 Sobic.001G489550 - -
4 Sobic.010G008433 - -
5 Sobic.002G413100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G117850 - -
7 Sobic.004G320900 - -
8 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
9 Sobic.002G245700 slowmo homolog, putative, expressed -
10 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
11 Sobic.002G270733 - -
12 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
13 Sobic.003G172701 - -
14 Sobic.002G148166 - -
15 Sobic.010G102700 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
16 Sobic.009G148950 - -
17 Sobic.010G238000 - -
18 Sobic.007G223250 - -
19 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
20 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic001G472050--Sobic005G093901 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G472050--Sobic002G423901 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic001G472050--Sobic001G489550 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G472050--Sobic010G008433 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic001G472050--Sobic002G413100 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic001G472050--Sobic003G117850 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic001G472050--Sobic004G320900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic001G472050--Sobic004G087000 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic001G472050--Sobic002G245700 Sobic005G093901--Sobic002G413100 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic005G093901--Sobic009G148950 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic005G093901--Sobic003G172701 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic007G109200 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic005G093901--Sobic002G270733 Sobic005G093901--Sobic003G117850 Sobic005G093901--Sobic004G087000 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic005G093901--Sobic006G057050 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G093901--Sobic001G022700 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic002G423901--Sobic002G288700 Sobic002G423901--Sobic001G472050 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic002G423901--Sobic007G223250 Sobic002G423901--Sobic010G008433 Sobic002G423901--Sobic004G087000 Sobic002G423901--Sobic005G093901 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic002G423901--Sobic003G354050 Sobic002G423901--Sobic007G109200 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic002G423901--Sobic001G234733 Sobic001G489550--Sobic010G008433 Sobic001G489550--Sobic004G320900 Sobic001G489550--Sobic001G472050 Sobic001G489550--Sobic002G423901 Sobic001G489550--Sobic007G223250 Sobic001G489550--Sobic005G093901 Sobic001G489550--Sobic002G288700 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic001G489550--Sobic002G148166 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic001G489550--Sobic010G102700 Sobic010G008433--Sobic001G489550 Sobic010G008433--Sobic007G223250 Sobic010G008433--Sobic002G288700 Sobic010G008433--Sobic002G423901 Sobic010G008433--Sobic002G148166 Sobic010G008433--Sobic004G087000 Sobic010G008433--Sobic001G472050 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic010G008433--Sobic002G222000 Sobic010G008433--Sobic007G109200 Sobic002G413100--Sobic005G093901 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic002G413100--Sobic010G268500 Sobic002G413100--Sobic003G117850 Sobic002G413100--Sobic001G022700 Sobic002G413100--Sobic009G148950 Sobic002G413100--Sobic003G172701 Sobic002G413100--Sobic002G270733 Sobic002G413100--Sobic006G057050 Sobic002G413100--Sobic007G109200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic003G117850 Sobic004G320900--Sobic007G207100 Sobic004G320900--Sobic002G270733 Sobic004G320900--Sobic001G489550 Sobic004G320900--Sobic002G148166 Sobic004G320900--Sobic005G093901 Sobic004G320900--Sobic009G148950 Sobic004G320900--Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic003G172600 Sobic004G087000--Sobic007G109200 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic004G087000--Sobic004G251400 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172701 Sobic004G087000--Sobic002G148166 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G087000--Sobic003G173266 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic004G087000--Sobic003G169300 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic002G222000 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic002G245700--Sobic007G199901 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic002G245700--Sobic004G169401 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G245700--Sobic001G413300 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G245700--Sobic003G208200 Sobic002G245700--Sobic004G320900 Sobic002G245700--Sobic002G413100 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic002G245700--Sobic003G053100 Sobic002G245700--Sobic003G117850 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic002G245700--Sobic004G176950
Octagon: transcription factors


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