Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G008433.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQZ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02200.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G489550 - -
2 Sobic.007G223250 - -
3 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
4 Sobic.002G423901 - -
5 Sobic.002G148166 - -
6 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
7 Sobic.001G472050 - -
8 Sobic.002G222000 - -
9 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
10 Sobic.005G002050 - -
11 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
12 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
13 Sobic.010G254000 cycloartenol synthase, putative, expressed K19011: achilleol B synthase
14 Sobic.005G093901 - -
15 Sobic.004G320900 - -
16 Sobic.003G117850 - -
17 Sobic.010G102700 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
18 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
19 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
20 Sobic.003G172701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic010G008433--Sobic001G489550 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic010G008433--Sobic007G223250 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic010G008433--Sobic002G288700 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic010G008433--Sobic002G423901 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic010G008433--Sobic002G148166 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic010G008433--Sobic004G087000 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic010G008433--Sobic001G472050 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic010G008433--Sobic002G222000 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic010G008433--Sobic007G109200 Sobic001G489550--Sobic010G008433 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic001G489550--Sobic004G320900 Sobic001G489550--Sobic001G472050 Sobic001G489550--Sobic002G423901 Sobic001G489550--Sobic007G223250 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic001G489550--Sobic005G093901 Sobic001G489550--Sobic002G288700 Sobic001G489550--Sobic002G148166 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic001G489550--Sobic010G102700 Sobic007G223250--Sobic002G288700 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic007G223250--Sobic002G014900 Sobic007G223250--Sobic004G087000 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic007G223250--Sobic006G123800 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic007G223250--Sobic001G266000 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic007G223250--Sobic002G150032 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G223250--Sobic003G172900 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic007G109200 Sobic002G288700--Sobic007G223250 Sobic002G288700--Sobic006G123800 Sobic002G288700--Sobic004G087000 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic002G288700--Sobic003G173266 Sobic002G288700--Sobic001G266000 Sobic002G288700--Sobic002G014900 Sobic002G288700--Sobic007G109200 Sobic002G288700--Sobic003G172900 Sobic002G288700--Sobic004G251400 Sobic002G423901--Sobic002G288700 Sobic002G423901--Sobic001G472050 Sobic002G423901--Sobic007G223250 Sobic002G423901--Sobic010G008433 Sobic002G423901--Sobic004G087000 Sobic002G423901--Sobic005G093901 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic002G423901--Sobic003G354050 Sobic002G423901--Sobic007G109200 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic002G423901--Sobic001G234733 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic004G087000--Sobic007G109200 Sobic004G087000--Sobic004G251400 Sobic004G087000--Sobic003G172900 Sobic004G087000--Sobic003G172701 Sobic004G087000--Sobic002G148166 Sobic004G087000--Sobic003G173266 Sobic004G087000--Sobic003G169300 Sobic004G087000--Sobic005G110493 Sobic004G087000--Sobic002G222000 Sobic001G472050--Sobic005G093901 Sobic001G472050--Sobic002G423901 Sobic001G472050--Sobic001G489550 Sobic001G472050--Sobic010G008433 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic001G472050--Sobic002G413100 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic001G472050--Sobic003G117850 Sobic001G472050--Sobic004G320900 Sobic001G472050--Sobic004G087000 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic001G472050--Sobic002G245700 Sobic002G222000--Sobic003G172900 Sobic002G222000--Sobic002G148166 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic002G222000--Sobic010G254000 Sobic002G222000--Sobic003G173266 Sobic002G222000--Sobic001G266000 Sobic002G222000--Sobic005G002050 Sobic002G222000--Sobic003G169300 Sobic002G222000--Sobic005G110493 Sobic002G222000--Sobic003G130200 Sobic007G109200--Sobic004G087000 Sobic007G109200--Sobic003G172701 Sobic007G109200--Sobic004G251400 Sobic007G109200--Sobic003G172900 Sobic007G109200--Sobic002G148166 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic006G057050 Sobic007G109200--Sobic003G169300 Sobic007G109200--Sobic003G173266 Sobic007G109200--Sobic005G110493
Octagon: transcription factors


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