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Transcriptome id Sobic.004G176950.1
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UniProt A0A1Z5RN52
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G245700 slowmo homolog, putative, expressed -
2 Sobic.002G413100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G148000 a WRKY transcription factor which regulates cell wall biosynthesis genes. Seed shattering-related gene.(PubMedID : 24019506)@WRKY60, expressed -
4 Sobic.010G268500 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
5 Sobic.003G053100 - -
6 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
7 Sobic.003G208200 - -
8 Sobic.007G199901 - -
9 Sobic.003G117850 - -
10 Sobic.003G172300 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
11 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.004G169401 - -
13 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
14 Sobic.003G161900 - -
15 Sobic.009G170050 - -
16 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
17 Sobic.005G093901 - -
18 Sobic.003G172600 - -
19 Sobic.002G033550 - -
20 Sobic.003G172800 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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