Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G380300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QND0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G359150 - -
2 Sobic.005G025001 - -
3 Sobic.010G133566 - -
4 Sobic.010G207325 - -
5 Sobic.004G242250 - -
6 Sobic.003G208100 Mo25, putative, expressed -
7 Sobic.003G153150 - -
8 Sobic.010G173500 - -
9 Sobic.007G117900 - -
10 Sobic.008G044200 - -
11 Sobic.006G068900 expressed protein -
12 Sobic.003G136100 cinnamoyl CoA reductase, putative, expressed K09753: cinnamoyl-CoA reductase
13 Sobic.001G107150 - -
14 Sobic.002G109200 - -
15 Sobic.001G371500 - -
16 Sobic.004G099650 - -
17 Sobic.010G059100 - -
18 Sobic.003G089400 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
19 Sobic.009G018600 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.3 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
20 Sobic.007G054300 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic004G359150 Sobic004G359150 Sobic001G380300--Sobic004G359150 Sobic005G025001 Sobic005G025001 Sobic001G380300--Sobic005G025001 Sobic010G133566 Sobic010G133566 Sobic001G380300--Sobic010G133566 Sobic010G207325 Sobic010G207325 Sobic001G380300--Sobic010G207325 Sobic004G242250 Sobic004G242250 Sobic001G380300--Sobic004G242250 Sobic003G208100 Sobic003G208100 Sobic001G380300--Sobic003G208100 Sobic003G153150 Sobic003G153150 Sobic001G380300--Sobic003G153150 Sobic010G173500 Sobic010G173500 Sobic001G380300--Sobic010G173500 Sobic007G117900 Sobic007G117900 Sobic001G380300--Sobic007G117900 Sobic003G137832 Sobic003G137832 Sobic004G359150--Sobic003G137832 Sobic002G258200 Sobic002G258200 Sobic004G359150--Sobic002G258200 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G359150--Sobic001G018700 Sobic005G025001--Sobic004G242250 Sobic001G107150 Sobic001G107150 Sobic005G025001--Sobic001G107150 Sobic001G273400 Sobic001G273400 Sobic005G025001--Sobic001G273400 Sobic001G244800 Sobic001G244800 Sobic005G025001--Sobic001G244800 Sobic003G075632 Sobic003G075632 Sobic005G025001--Sobic003G075632 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic005G025001--Sobic001G374301 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic005G025001--Sobic005G017632 Sobic005G112400 Sobic005G112400 Sobic005G025001--Sobic005G112400 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic005G025001--Sobic006G176300 Sobic010G133566--Sobic004G359150 Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic010G133566--Sobic001G154800 Sobic009G168500 Sobic009G168500 Sobic010G133566--Sobic009G168500 Sobic010G133566--Sobic010G207325 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic010G133566--Sobic004G177050 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic010G133566--Sobic002G069700 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic010G133566--Sobic010G101350 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic010G133566--Sobic009G196500 Sobic001G110150 Sobic001G110150 Sobic010G133566--Sobic001G110150 Sobic006G025132 Sobic006G025132 Sobic010G207325--Sobic006G025132 Sobic010G207325--Sobic004G359150 Sobic007G116733 Sobic007G116733 Sobic010G207325--Sobic007G116733 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic010G207325--Sobic006G218050 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic010G207325--Sobic004G246950 Sobic001G120700 Sobic001G120700 Sobic010G207325--Sobic001G120700 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic010G207325--Sobic007G181801 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic010G207325--Sobic001G030800 Sobic010G207325--Sobic005G017632 Sobic004G242250--Sobic001G107150 Sobic004G099650 Sobic004G099650 Sobic004G242250--Sobic004G099650 Sobic004G242250--Sobic001G244800 Sobic007G007250 Sobic007G007250 Sobic004G242250--Sobic007G007250 Sobic004G242250--Sobic001G374301 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic004G242250--Sobic005G193900 Sobic004G242250--Sobic003G075632 Sobic004G242250--Sobic005G025001 Sobic004G242250--Sobic001G018700 Sobic010G207100 Sobic010G207100 Sobic003G208100--Sobic010G207100 Sobic010G244200 Sobic010G244200 Sobic003G208100--Sobic010G244200 Sobic010G138800 Sobic010G138800 Sobic003G208100--Sobic010G138800 Sobic001G434000 Sobic001G434000 Sobic003G208100--Sobic001G434000 Sobic007G124500 Sobic007G124500 Sobic003G208100--Sobic007G124500 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic003G208100--Sobic001G250000 Sobic010G231500 Sobic010G231500 Sobic003G208100--Sobic010G231500 Sobic009G018600 Sobic009G018600 Sobic003G208100--Sobic009G018600 Sobic010G100900 Sobic010G100900 Sobic003G208100--Sobic010G100900 Sobic003G153150--Sobic004G242250 Sobic005G191000 Sobic005G191000 Sobic003G153150--Sobic005G191000 Sobic003G153150--Sobic004G099650 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic003G153150--Sobic001G302000 Sobic003G153150--Sobic001G374301 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic003G153150--Sobic003G066200 Sobic003G153150--Sobic006G025132 Sobic003G153150--Sobic007G007250 Sobic003G153150--Sobic001G107150 Sobic010G173500--Sobic001G380300 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic010G173500--Sobic002G109200 Sobic010G173500--Sobic009G018600 Sobic010G173500--Sobic004G359150 Sobic008G015400 Sobic008G015400 Sobic010G173500--Sobic008G015400 Sobic010G173500--Sobic010G207325 Sobic010G173500--Sobic003G208100 Sobic008G044200 Sobic008G044200 Sobic010G173500--Sobic008G044200 Sobic003G386500 Sobic003G386500 Sobic010G173500--Sobic003G386500 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic007G117900--Sobic003G108050 Sobic001G369101 Sobic001G369101 Sobic007G117900--Sobic001G369101 Sobic003G185800 Sobic003G185800 Sobic007G117900--Sobic003G185800 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic007G117900--Sobic010G230100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic007G117900--Sobic009G206900 Sobic009G230300 Sobic009G230300 Sobic007G117900--Sobic009G230300 Sobic005G197900 Sobic005G197900 Sobic007G117900--Sobic005G197900 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic007G117900--Sobic007G151900 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic007G117900--Sobic010G263051
Octagon: transcription factors


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