Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G394900.2,Sobic.001G394900.3,Sobic.001G394900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S9V4 , A0A1B6QNN9 , A0A1Z5S9V7
Pfam -
Panther DB PTHR35096 PTHR35096:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06320 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002154
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G053620.1 , HORVU4Hr1G053560.2
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G394900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G324800 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G294100 ZOS2-14 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.010G022600 encodes granule-bound ADP-glucose-gluosyl transferase(PubMedID : 20585750)@-(PubMedID : 9866201)@starch synthase, putative, expressed K13679: granule-bound starch synthase
4 Sobic.004G099750 - -
5 Sobic.003G402100 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G107300 - -
7 Sobic.005G226150 - -
8 Sobic.001G175501 - -
9 Sobic.008G088881 - -
10 Sobic.009G116500 esterase, putative, expressed -
11 Sobic.002G417900 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.009G227000 expressed protein -
13 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
14 Sobic.008G039700 expressed protein -
15 Sobic.004G261000 expressed protein -
16 Sobic.008G081000 - -
17 Sobic.001G068200 - -
18 Sobic.002G089400 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G205100 AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic001G394900--Sobic001G324800 Sobic004G294100 Sobic004G294100 Sobic001G394900--Sobic004G294100 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic001G394900--Sobic010G022600 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic001G394900--Sobic004G099750 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic001G394900--Sobic003G402100 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic001G394900--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic001G394900--Sobic005G226150 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic001G394900--Sobic001G175501 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic001G394900--Sobic008G088881 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic001G324800--Sobic003G092600 Sobic001G324800--Sobic001G394900 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic001G324800--Sobic002G015800 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic001G324800--Sobic002G360900 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic001G324800--Sobic004G262100 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic001G324800--Sobic006G015800 Sobic001G324800--Sobic010G022600 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic001G324800--Sobic001G509100 Sobic001G324800--Sobic010G107300 Sobic004G294100--Sobic004G099750 Sobic004G294100--Sobic001G175501 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic004G294100--Sobic006G178400 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic004G294100--Sobic003G135000 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic004G294100--Sobic001G158600 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic004G294100--Sobic001G253400 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic004G294100--Sobic005G193700 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic004G294100--Sobic004G139700 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic004G294100--Sobic006G104800 Sobic010G022600--Sobic005G226150 Sobic010G022600--Sobic010G107300 Sobic002G417900 Sobic002G417900 Sobic010G022600--Sobic002G417900 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic010G022600--Sobic004G085100 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic010G022600--Sobic001G362900 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic010G022600--Sobic002G088000 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic010G022600--Sobic005G083160 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic010G022600--Sobic004G171500 Sobic001G297800 Sobic001G297800 Sobic010G022600--Sobic001G297800 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic004G099750--Sobic006G051750 Sobic004G099750--Sobic001G175501 Sobic004G099750--Sobic001G158600 Sobic004G099750--Sobic001G253400 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic004G099750--Sobic004G261000 Sobic004G099750--Sobic005G193700 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic004G099750--Sobic005G153200 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic004G099750--Sobic001G259250 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic004G099750--Sobic004G142000 Sobic003G402100--Sobic001G394900 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G402100--Sobic001G170500 Sobic007G023600 Sobic007G023600 Sobic003G402100--Sobic007G023600 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic003G402100--Sobic004G254400 Sobic001G053700 Sobic001G053700 Sobic003G402100--Sobic001G053700 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic003G402100--Sobic010G180200 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic003G402100--Sobic009G227000 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic003G402100--Sobic004G274500 Sobic008G176300 Sobic008G176300 Sobic003G402100--Sobic008G176300 Sobic010G107300--Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G226150 Sobic010G107300--Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic008G088881 Sobic010G107300--Sobic002G360900 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic010G107300--Sobic001G233900 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G247700 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic003G323000 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic010G107300--Sobic007G070700 Sobic005G226150--Sobic003G247700 Sobic005G226150--Sobic007G070700 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G226150--Sobic009G245750 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G226150--Sobic001G253501 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G088881 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic005G226150--Sobic009G001600 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G226150--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic005G226150--Sobic007G025300 Sobic001G175501--Sobic004G099750 Sobic001G175501--Sobic001G158600 Sobic001G175501--Sobic005G193700 Sobic001G175501--Sobic001G253400 Sobic001G175501--Sobic004G294100 Sobic001G175501--Sobic006G051750 Sobic001G175501--Sobic004G261000 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic001G175501--Sobic002G409250 Sobic001G175501--Sobic005G153200 Sobic008G088881--Sobic005G226150 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088881--Sobic009G007500 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic008G088881--Sobic006G062700 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G088881--Sobic008G088450 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic008G103066 Sobic008G088881--Sobic007G070700 Sobic008G088881--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic008G088881--Sobic001G249233
Octagon: transcription factors


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