Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G419900.1
Synonym AT-HSC70-1, HSC70, HSP70-1, Sb01g039510, HSC70-1
Functional annotation Up-reguralion under heat (PubMedID : 24916767)
DnaK family protein, putative, expressed
UniProt C5WPF5
Pfam PF00012
Panther DB PTHR19375 PTHR19375:SF199
NCBI CDD -
KEGG Orthology K03283; heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02500 : heat shock cognate protein 70-1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g38530.1 : DnaK family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001861 , Zm00025a039687 , Zm00025a001857
Brachypodium KQK22333 , KQJ83914 , KQK22319 , KQK05900
Barley HORVU6Hr1G082530.1 , HORVU6Hr1G082510.4 , HORVU6Hr1G082510.5 , HORVU6Hr1G082510.3 , HORVU6Hr1G082510.1 , HORVU6Hr1G082510.2
Wheat TraesCS6A02G342200 , TraesCS4D02G207100 , TraesCS6A02G342500 , TraesCS6D02G322800 , TraesCS4A02G098100 , TraesCS6B02G374500 , TraesCS4A02G098200 , TraesCS6B02G374400 , TraesCS4B02G206400 , TraesCS6D02G322700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G134600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed K03437: RNA methyltransferase, TrmH family
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20 Sobic.006G272450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G419900 Sobic001G419900 Sobic001G134600 Sobic001G134600 Sobic001G419900--Sobic001G134600 Sobic002G034400 Sobic002G034400 Sobic001G419900--Sobic002G034400 Sobic005G097700 Sobic005G097700 Sobic001G419900--Sobic005G097700 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic001G419900--Sobic002G052500 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic001G419900--Sobic004G356600 Sobic001G378550 Sobic001G378550 Sobic001G419900--Sobic001G378550 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic001G419900--Sobic006G090201 Sobic009G070900 Sobic009G070900 Sobic001G419900--Sobic009G070900 Sobic002G175550 Sobic002G175550 Sobic001G419900--Sobic002G175550 Sobic001G134600--Sobic001G378550 Sobic001G134600--Sobic002G052500 Sobic001G134600--Sobic001G419900 Sobic001G049000 Sobic001G049000 Sobic001G134600--Sobic001G049000 Sobic001G134600--Sobic004G356600 Sobic001G267266 Sobic001G267266 Sobic001G134600--Sobic001G267266 Sobic001G134600--Sobic006G090201 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic001G134600--Sobic003G343100 Sobic001G063900 Sobic001G063900 Sobic001G134600--Sobic001G063900 Sobic002G034400--Sobic004G356600 Sobic002G034400--Sobic005G097700 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic002G034400--Sobic002G356700 Sobic006G228400 Sobic006G228400 Sobic002G034400--Sobic006G228400 Sobic002G034400--Sobic002G052500 Sobic002G034400--Sobic006G090201 Sobic006G260600 Sobic006G260600 Sobic002G034400--Sobic006G260600 Sobic002G004400 Sobic002G004400 Sobic002G034400--Sobic002G004400 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic002G034400--Sobic003G245700 Sobic005G097700--Sobic002G175550 Sobic005G097700--Sobic004G356600 Sobic005G097700--Sobic002G004400 Sobic005G097700--Sobic006G090201 Sobic007G210400 Sobic007G210400 Sobic005G097700--Sobic007G210400 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic005G097700--Sobic007G072901 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic005G097700--Sobic003G357000 Sobic005G097700--Sobic002G034400 Sobic005G097700--Sobic006G228400 Sobic002G052500--Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic003G245700 Sobic002G052500--Sobic003G343100 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic002G052500--Sobic008G023500 Sobic002G052500--Sobic006G090201 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic002G052500--Sobic006G185400 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic002G052500--Sobic009G010800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic003G178200 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic002G052500--Sobic004G330500 Sobic004G356600--Sobic006G090201 Sobic004G356600--Sobic007G072901 Sobic004G356600--Sobic009G010800 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic004G356600--Sobic001G361500 Sobic003G423100 Sobic003G423100 Sobic004G356600--Sobic003G423100 Sobic004G356600--Sobic003G357000 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic004G356600--Sobic009G164200 Sobic004G356600--Sobic006G185400 Sobic004G356600--Sobic003G245700 Sobic001G378550--Sobic006G185400 Sobic001G378550--Sobic004G330500 Sobic001G378550--Sobic003G343100 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic001G378550--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic001G378550--Sobic005G189400 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G378550--Sobic005G037500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G378550--Sobic006G209100 Sobic006G090201--Sobic005G189400 Sobic006G090201--Sobic004G330500 Sobic006G090201--Sobic006G185400 Sobic006G090201--Sobic007G152200 Sobic006G090201--Sobic006G209100 Sobic006G090201--Sobic003G245700 Sobic006G090201--Sobic001G361500 Sobic006G090201--Sobic008G023500 Sobic006G090201--Sobic002G205201 Sobic006G272450 Sobic006G272450 Sobic009G070900--Sobic006G272450 Sobic009G070900--Sobic001G378550 Sobic009G070900--Sobic002G052500 Sobic009G070900--Sobic008G023500 Sobic009G070900--Sobic006G090201 Sobic009G070900--Sobic003G245700 Sobic009G070900--Sobic009G164200 Sobic009G070900--Sobic002G356700 Sobic009G070900--Sobic006G185400 Sobic002G175550--Sobic005G097700 Sobic002G175550--Sobic007G210400 Sobic002G175550--Sobic002G004400 Sobic002G175550--Sobic001G378550 Sobic002G175550--Sobic006G090201 Sobic003G221300 Sobic003G221300 Sobic002G175550--Sobic003G221300 Sobic002G175550--Sobic005G037500 Sobic002G175550--Sobic004G330500 Sobic002G175550--Sobic005G189400
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