Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G002800.1
Synonym GLUR3, Sb02g000440, ATGLR3.4, GLR3.4
Functional annotation glutamate receptor, putative, expressed
UniProt C5X741
Pfam PF13458 PF00497 PF00060
Panther DB PTHR18966 PTHR18966:SF235
NCBI CDD KOG1052; Glutamate-gated kainate-type ion channel receptor subunit GluR5 and related subunits
KEGG Orthology K05387; glutamate receptor, ionotropic, plant
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0004970ionotropic glutamate receptor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05200 : glutamate receptor 3.4
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01310.1 : glutamate receptor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044837 , Zm00025a044838
Brachypodium KQK21239
Barley -
Wheat TraesCS2D02G265700 , TraesCS2D02G265700 , TraesCS2A02G257200 , TraesCS2B02G285400 , TraesCS2B02G285400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G149650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G002800 Sobic002G002800 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic002G002800--Sobic001G062200 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic002G002800--Sobic006G167850 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic002G002800--Sobic002G342901 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic002G002800--Sobic006G262001 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G002800--Sobic007G059800 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic002G002800--Sobic003G146450 Sobic003G427550 Sobic003G427550 Sobic002G002800--Sobic003G427550 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G002800--Sobic003G372950 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G002800--Sobic004G201200 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic003G372950 Sobic001G062200--Sobic007G059800 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic001G062200--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic001G062200--Sobic003G064000 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic001G062200--Sobic008G166000 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic004G201200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic001G062200--Sobic008G154200 Sobic006G167850--Sobic008G154200 Sobic006G167850--Sobic003G064000 Sobic006G167850--Sobic003G372950 Sobic006G167850--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic006G167850--Sobic006G223700 Sobic006G167850--Sobic005G057600 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic006G167850--Sobic003G126700 Sobic006G167850--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic006G167850--Sobic001G443850 Sobic002G342901--Sobic003G146450 Sobic002G342901--Sobic006G223700 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic002G342901--Sobic007G176300 Sobic002G342901--Sobic003G126700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic002G342901--Sobic002G269800 Sobic002G342901--Sobic008G154200 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic002G342901--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic002G342901--Sobic009G197350 Sobic002G342901--Sobic003G064000 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic006G262001--Sobic004G295200 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic006G262001--Sobic001G025201 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic006G262001--Sobic002G069601 Sobic006G262001--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic006G262001--Sobic003G318400 Sobic006G262001--Sobic005G181700 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic006G262001--Sobic003G353050 Sobic006G262001--Sobic004G201200 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic006G262001--Sobic001G267950 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic003G146450--Sobic006G223700 Sobic003G146450--Sobic003G126700 Sobic003G146450--Sobic002G342901 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic002G269800 Sobic003G146450--Sobic008G154200 Sobic003G146450--Sobic009G156700 Sobic003G146450--Sobic009G197350 Sobic003G146450--Sobic003G064000 Sobic003G427550--Sobic007G154001 Sobic003G427550--Sobic008G154200 Sobic003G427550--Sobic006G167850 Sobic003G427550--Sobic003G372950 Sobic003G427550--Sobic003G064000 Sobic003G427550--Sobic004G286450 Sobic003G427550--Sobic006G223700 Sobic003G427550--Sobic003G126700 Sobic003G427550--Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic004G201200--Sobic007G059800 Sobic004G201200--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic005G057600 Sobic004G201200--Sobic003G318400 Sobic004G201200--Sobic001G062200 Sobic004G201200--Sobic002G069601 Sobic004G201200--Sobic003G372950 Sobic004G201200--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic001G025201
Octagon: transcription factors


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