Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G304475.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQC7
Pfam -
Panther DB PTHR31060 PTHR31060:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50780 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40480.2 : H-BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004549
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G128233 - -
2 Sobic.010G133800 - -
3 Sobic.001G499400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
4 Sobic.006G174725 - -
5 Sobic.003G146450 - -
6 Sobic.002G323800 expressed protein -
7 Sobic.001G062200 AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G372950 - -
9 Sobic.002G342901 - -
10 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G064000 expressed protein -
12 Sobic.007G193000 expressed protein -
13 Sobic.004G286450 - -
14 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G154001 - -
16 Sobic.005G057600 expressed protein -
17 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G167850 - -
19 Sobic.001G443850 - -
20 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic004G304475--Sobic006G128233 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic004G304475--Sobic010G133800 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic004G304475--Sobic001G499400 Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic004G304475--Sobic006G174725 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic004G304475--Sobic003G146450 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic004G304475--Sobic002G323800 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G304475--Sobic001G062200 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic004G304475--Sobic003G372950 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic004G304475--Sobic002G342901 Sobic006G128233--Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic002G323800 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic004G304475 Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic006G174725 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic004G023800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic006G128233--Sobic009G087360 Sobic003G125200 Sobic003G125200 Sobic006G128233--Sobic003G125200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic010G133800--Sobic008G154200 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic010G133800--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic010G133800--Sobic006G223700 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic010G133800--Sobic003G126700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic010G133800--Sobic006G167850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic002G269800 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic010G133800--Sobic005G057600 Sobic001G499400--Sobic006G128233 Sobic001G499400--Sobic004G304475 Sobic001G499400--Sobic004G023800 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic001G499400--Sobic003G396050 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic001G499400--Sobic006G192150 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G499400--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G499400--Sobic004G143550 Sobic001G499400--Sobic009G087360 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic001G499400--Sobic006G033601 Sobic006G174725--Sobic002G323800 Sobic006G174725--Sobic003G372950 Sobic006G174725--Sobic004G286450 Sobic006G174725--Sobic003G064000 Sobic006G174725--Sobic001G062200 Sobic006G174725--Sobic005G057600 Sobic006G174725--Sobic008G154200 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic006G174725--Sobic007G059800 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic006G174725--Sobic004G201200 Sobic003G146450--Sobic006G223700 Sobic003G146450--Sobic003G126700 Sobic003G146450--Sobic002G342901 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic002G269800 Sobic003G146450--Sobic008G154200 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic003G146450--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic003G146450--Sobic009G197350 Sobic003G146450--Sobic003G064000 Sobic002G323800--Sobic006G174725 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic006G280700 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic003G372950 Sobic002G323800--Sobic004G286450 Sobic002G323800--Sobic004G201200 Sobic001G062200--Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic003G372950 Sobic001G062200--Sobic007G059800 Sobic001G062200--Sobic004G286450 Sobic001G062200--Sobic003G064000 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic001G062200--Sobic008G166000 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic004G201200 Sobic001G062200--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic002G342901--Sobic003G146450 Sobic002G342901--Sobic006G223700 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic002G342901--Sobic007G176300 Sobic002G342901--Sobic003G126700 Sobic002G342901--Sobic002G269800 Sobic002G342901--Sobic008G154200 Sobic002G342901--Sobic009G156700 Sobic002G342901--Sobic009G197350 Sobic002G342901--Sobic003G064000
Octagon: transcription factors


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