Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G499400.1
Synonym Sb01g046650
Functional annotation heavy metal-associated domain containing protein, expressed
UniProt C5WXT6
Pfam PF00403
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF86
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66110 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g06080.1 : heavy metal-associated domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G077100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G128233 - -
2 Sobic.004G304475 - -
3 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
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17 Sobic.002G323800 expressed protein -
18 Sobic.K004201 - -
19 Sobic.002G290900 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G247700 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14407: CSTF2, cleavage stimulation factor subunit 2


Gene co-expression network
sample Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic001G499400--Sobic006G128233 Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic001G499400--Sobic004G304475 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G499400--Sobic004G023800 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic001G499400--Sobic003G396050 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic001G499400--Sobic006G192150 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G499400--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G499400--Sobic004G143550 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic001G499400--Sobic009G087360 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic001G499400--Sobic006G033601 Sobic006G128233--Sobic001G499400 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic006G128233--Sobic002G323800 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic004G304475 Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic010G247700 Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic006G128233--Sobic006G174725 Sobic006G128233--Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic009G087360 Sobic003G125200 Sobic003G125200 Sobic006G128233--Sobic003G125200 Sobic004G304475--Sobic006G128233 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic004G304475--Sobic010G133800 Sobic004G304475--Sobic001G499400 Sobic004G304475--Sobic006G174725 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic004G304475--Sobic003G146450 Sobic004G304475--Sobic002G323800 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G304475--Sobic001G062200 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic004G304475--Sobic003G372950 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic004G304475--Sobic002G342901 Sobic004G023800--Sobic003G024450 Sobic004G023800--Sobic004G143550 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic004G023800--Sobic003G288700 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic004G023800--Sobic006G065000 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic008G053800 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic004G023800--Sobic001G440401 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic004G092950 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic004G023800--Sobic009G184450 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic004G023800--Sobic010G149000 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic003G396050--Sobic003G123950 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic003G396050--Sobic010G053700 Sobic003G396050--Sobic006G033601 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G396050--Sobic008G156800 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic003G396050--Sobic002G170000 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic004G143550 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G396050--Sobic008G116800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G396050--Sobic003G112100 Sobic006G192150--Sobic009G087360 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic006G192150--Sobic004G193100 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic006G192150--Sobic002G314100 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic006G192150--Sobic003G388201 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic006G192150--Sobic010G023132 Sobic006G192150--Sobic001G499400 Sobic006G192150--Sobic004G143550 Sobic006G192150--Sobic003G024450 Sobic006G192150--Sobic003G396050 Sobic003G024450--Sobic004G143550 Sobic003G024450--Sobic004G023800 Sobic003G024450--Sobic010G149000 Sobic003G024450--Sobic004G092950 Sobic003G024450--Sobic003G388201 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G024450--Sobic001G202800 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic003G024450--Sobic002G117800 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic003G024450--Sobic003G365450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic003G024450--Sobic008G060800 Sobic004G143550--Sobic003G024450 Sobic004G143550--Sobic004G023800 Sobic004G143550--Sobic003G388201 Sobic004G143550--Sobic010G149000 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic004G143550--Sobic004G194600 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic004G143550--Sobic004G207733 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic004G143550--Sobic001G045900 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G143550--Sobic002G147550 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic004G143550--Sobic010G225175 Sobic009G087360--Sobic006G192150 Sobic009G087360--Sobic010G023132 Sobic009G087360--Sobic006G280700 Sobic009G087360--Sobic006G128233 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic009G087360--Sobic003G361150 Sobic009G087360--Sobic001G499400 Sobic009G087360--Sobic003G024450 Sobic009G087360--Sobic002G323800 Sobic009G087360--Sobic003G365450 Sobic006G033601--Sobic003G396050 Sobic006G033601--Sobic003G123950 Sobic006G033601--Sobic001G062066 Sobic006G033601--Sobic010G053700 Sobic006G033601--Sobic001G499400 Sobic006G033601--Sobic004G143550 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G033601--Sobic006G059150 Sobic006G033601--Sobic003G388201 Sobic006G033601--Sobic002G170000
Octagon: transcription factors


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