Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G125200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2S9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G128233 - -
2 Sobic.010G133800 - -
3 Sobic.004G304475 - -
4 Sobic.010G131101 - -
5 Sobic.002G323800 expressed protein -
6 Sobic.006G174725 - -
7 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G178000 Myb transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.003G372950 - -
10 Sobic.004G286450 - -
11 Sobic.003G064000 expressed protein -
12 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G184450 - -
15 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G025201 - -
17 Sobic.007G193000 expressed protein -
18 Sobic.004G061300 expressed protein -
19 Sobic.005G057600 expressed protein -
20 Sobic.001G071900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G125200 Sobic003G125200 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic003G125200--Sobic006G128233 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic003G125200--Sobic010G133800 Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic003G125200--Sobic004G304475 Sobic010G131101 Sobic010G131101 Sobic003G125200--Sobic010G131101 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic003G125200--Sobic002G323800 Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic003G125200--Sobic006G174725 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic003G125200--Sobic002G185000 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic003G125200--Sobic009G178000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G125200--Sobic003G372950 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic002G323800 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic004G304475 Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic006G174725 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic004G023800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic006G128233--Sobic009G087360 Sobic006G128233--Sobic003G125200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic010G133800--Sobic008G154200 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic010G133800--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic010G133800--Sobic006G223700 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic010G133800--Sobic003G126700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic010G133800--Sobic006G167850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic002G269800 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic010G133800--Sobic005G057600 Sobic004G304475--Sobic006G128233 Sobic004G304475--Sobic010G133800 Sobic004G304475--Sobic001G499400 Sobic004G304475--Sobic006G174725 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic004G304475--Sobic003G146450 Sobic004G304475--Sobic002G323800 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G304475--Sobic001G062200 Sobic004G304475--Sobic003G372950 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic004G304475--Sobic002G342901 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic010G131101--Sobic007G193000 Sobic010G131101--Sobic003G126700 Sobic010G131101--Sobic002G269800 Sobic010G131101--Sobic006G223700 Sobic010G131101--Sobic008G154200 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic010G131101--Sobic003G318350 Sobic010G131101--Sobic003G064000 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic010G131101--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic010G131101--Sobic009G197350 Sobic002G323800--Sobic006G174725 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic006G280700 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic003G372950 Sobic002G323800--Sobic004G286450 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G323800--Sobic004G201200 Sobic006G174725--Sobic002G323800 Sobic006G174725--Sobic003G372950 Sobic006G174725--Sobic004G286450 Sobic006G174725--Sobic003G064000 Sobic006G174725--Sobic001G062200 Sobic006G174725--Sobic005G057600 Sobic006G174725--Sobic008G154200 Sobic006G174725--Sobic007G059800 Sobic006G174725--Sobic004G201200 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic009G178000--Sobic004G026900 Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic009G178000--Sobic004G169800 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic002G185000 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic001G025201 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G286650 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic009G178000--Sobic003G353050 Sobic009G178000--Sobic010G133800 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G372950--Sobic007G154001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.