Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G071900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G178000 Myb transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.003G125200 - -
3 Sobic.002G323800 expressed protein -
4 Sobic.002G235000 expressed protein -
5 Sobic.006G128233 - -
6 Sobic.001G025201 - -
7 Sobic.006G280700 - -
8 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G353050 - -
10 Sobic.004G295200 expressed protein -
11 Sobic.006G259501 - -
12 Sobic.006G262001 - -
13 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G174725 - -
15 Sobic.001G258700 - -
16 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G247700 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14407: CSTF2, cleavage stimulation factor subunit 2
18 Sobic.009G235801 - -
19 Sobic.007G059800 expressed protein -
20 Sobic.001G267950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G071900 Sobic001G071900 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic001G071900--Sobic009G178000 Sobic003G125200 Sobic003G125200 Sobic001G071900--Sobic003G125200 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic001G071900--Sobic002G323800 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic001G071900--Sobic002G235000 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic001G071900--Sobic006G128233 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic001G071900--Sobic001G025201 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic001G071900--Sobic006G280700 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic001G071900--Sobic002G185000 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G071900--Sobic003G353050 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic009G178000--Sobic004G026900 Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic009G178000--Sobic004G169800 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic002G185000 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic001G025201 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G353050 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic009G178000--Sobic010G133800 Sobic003G125200--Sobic006G128233 Sobic003G125200--Sobic010G133800 Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic003G125200--Sobic004G304475 Sobic010G131101 Sobic010G131101 Sobic003G125200--Sobic010G131101 Sobic003G125200--Sobic002G323800 Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic003G125200--Sobic006G174725 Sobic003G125200--Sobic002G185000 Sobic003G125200--Sobic009G178000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G125200--Sobic003G372950 Sobic002G323800--Sobic006G174725 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic006G280700 Sobic002G323800--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic007G059800 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic002G323800--Sobic004G286450 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G323800--Sobic004G201200 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic002G235000--Sobic001G418300 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic002G235000--Sobic006G259501 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic002G235000--Sobic006G018500 Sobic002G235000--Sobic003G353050 Sobic002G235000--Sobic002G185000 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic002G235000--Sobic003G076300 Sobic002G235000--Sobic001G258700 Sobic004G345300 Sobic004G345300 Sobic002G235000--Sobic004G345300 Sobic002G235000--Sobic009G178000 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic002G323800 Sobic006G128233--Sobic006G280700 Sobic006G128233--Sobic004G304475 Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic006G174725 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic004G023800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic006G128233--Sobic009G087360 Sobic006G128233--Sobic003G125200 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic006G280700--Sobic002G323800 Sobic006G280700--Sobic006G128233 Sobic006G280700--Sobic010G247700 Sobic006G280700--Sobic009G087360 Sobic006G280700--Sobic006G174725 Sobic001G284300 Sobic001G284300 Sobic006G280700--Sobic001G284300 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic006G280700--Sobic003G361150 Sobic006G280700--Sobic004G295200 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic006G280700--Sobic007G193000 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic003G353050--Sobic001G025201 Sobic003G353050--Sobic002G069601 Sobic003G353050--Sobic003G286650 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G353050--Sobic002G333200 Sobic003G353050--Sobic006G259501 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G353050--Sobic008G192200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic003G353050--Sobic001G272300
Octagon: transcription factors


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