Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G174725.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt Q6JAH1 , A0A1Z5REE4
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31719 PTHR31719:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69490 : NAC-like, activated by AP3/PI
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43960.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G323800 expressed protein -
2 Sobic.003G372950 - -
3 Sobic.004G286450 - -
4 Sobic.003G064000 expressed protein -
5 Sobic.001G062200 AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G057600 expressed protein -
7 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G059800 expressed protein -
9 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G427550 - -
11 Sobic.008G166000 - -
12 Sobic.001G443850 - -
13 Sobic.005G181700 NB-ARC domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G154001 - -
15 Sobic.001G025201 - -
16 Sobic.006G167850 - -
17 Sobic.007G193000 expressed protein -
18 Sobic.004G295200 expressed protein -
19 Sobic.004G149433 - -
20 Sobic.005G229232 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic006G174725--Sobic002G323800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic006G174725--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic006G174725--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G174725--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic006G174725--Sobic001G062200 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic006G174725--Sobic005G057600 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G174725--Sobic008G154200 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic006G174725--Sobic007G059800 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic006G174725--Sobic004G201200 Sobic002G323800--Sobic006G174725 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic004G295200 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic002G323800--Sobic006G280700 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic003G372950 Sobic002G323800--Sobic004G286450 Sobic002G323800--Sobic004G201200 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic004G286450--Sobic003G372950 Sobic004G286450--Sobic003G064000 Sobic004G286450--Sobic008G154200 Sobic004G286450--Sobic005G057600 Sobic004G286450--Sobic006G167850 Sobic004G286450--Sobic001G062200 Sobic004G286450--Sobic001G443850 Sobic004G286450--Sobic006G223700 Sobic004G286450--Sobic007G154001 Sobic003G064000--Sobic003G372950 Sobic003G064000--Sobic008G154200 Sobic003G064000--Sobic004G286450 Sobic003G064000--Sobic005G057600 Sobic003G064000--Sobic006G167850 Sobic003G064000--Sobic006G223700 Sobic003G064000--Sobic001G443850 Sobic005G229232 Sobic005G229232 Sobic003G064000--Sobic005G229232 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic003G064000--Sobic003G126700 Sobic001G062200--Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic003G372950 Sobic001G062200--Sobic007G059800 Sobic001G062200--Sobic004G286450 Sobic001G062200--Sobic003G064000 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic001G062200--Sobic008G166000 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic004G201200 Sobic001G062200--Sobic008G154200 Sobic005G057600--Sobic003G372950 Sobic005G057600--Sobic004G286450 Sobic005G057600--Sobic003G064000 Sobic005G057600--Sobic007G059800 Sobic005G057600--Sobic001G062200 Sobic005G057600--Sobic008G154200 Sobic005G057600--Sobic004G201200 Sobic005G057600--Sobic005G181700 Sobic005G057600--Sobic008G166000 Sobic008G154200--Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G372950 Sobic008G154200--Sobic004G286450 Sobic008G154200--Sobic006G223700 Sobic008G154200--Sobic006G167850 Sobic008G154200--Sobic003G126700 Sobic008G154200--Sobic005G057600 Sobic008G154200--Sobic001G443850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic008G154200--Sobic002G269800 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic007G059800 Sobic004G201200--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic005G057600 Sobic004G201200--Sobic003G318400 Sobic004G201200--Sobic001G062200 Sobic004G201200--Sobic002G069601 Sobic004G201200--Sobic003G372950 Sobic004G201200--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic001G025201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.