Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G247700.1
Synonym CSTF64, Sb10g028650
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt C5Z8U1
Pfam PF00076
Panther DB PTHR23139 PTHR23139:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14407; CSTF2, cleavage stimulation factor subunit 2
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71800 : cleavage stimulating factor 64
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13999.1 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK17354
Barley HORVU7Hr1G098160.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic010G247700--Sobic002G323800 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic010G247700--Sobic006G280700 Sobic001G284300 Sobic001G284300 Sobic010G247700--Sobic001G284300 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic010G247700--Sobic006G128233 Sobic006G174725 Sobic006G174725 Sobic010G247700--Sobic006G174725 Sobic004G115200 Sobic004G115200 Sobic010G247700--Sobic004G115200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic010G247700--Sobic004G295200 Sobic001G141000 Sobic001G141000 Sobic010G247700--Sobic001G141000 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic010G247700--Sobic001G025201 Sobic002G323800--Sobic006G174725 Sobic002G323800--Sobic004G295200 Sobic002G323800--Sobic006G280700 Sobic002G323800--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G323800--Sobic007G059800 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic002G323800--Sobic005G057600 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G323800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic002G323800--Sobic004G286450 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G323800--Sobic004G201200 Sobic006G280700--Sobic002G323800 Sobic006G280700--Sobic006G128233 Sobic006G280700--Sobic010G247700 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic006G280700--Sobic009G087360 Sobic006G280700--Sobic006G174725 Sobic006G280700--Sobic001G284300 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic006G280700--Sobic003G361150 Sobic006G280700--Sobic004G295200 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic006G280700--Sobic007G193000 Sobic001G284300--Sobic001G141000 Sobic001G284300--Sobic004G115200 Sobic001G284300--Sobic010G247700 Sobic001G284300--Sobic006G280700 Sobic001G261428 Sobic001G261428 Sobic001G284300--Sobic001G261428 Sobic008G093101 Sobic008G093101 Sobic001G284300--Sobic008G093101 Sobic007G163200 Sobic007G163200 Sobic001G284300--Sobic007G163200 Sobic005G110529 Sobic005G110529 Sobic001G284300--Sobic005G110529 Sobic001G284300--Sobic006G128233 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic001G499400 Sobic006G128233--Sobic002G323800 Sobic006G128233--Sobic006G280700 Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic006G128233--Sobic004G304475 Sobic006G128233--Sobic010G247700 Sobic006G128233--Sobic006G174725 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic004G023800 Sobic006G128233--Sobic009G087360 Sobic003G125200 Sobic003G125200 Sobic006G128233--Sobic003G125200 Sobic006G174725--Sobic002G323800 Sobic006G174725--Sobic003G372950 Sobic006G174725--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G174725--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic006G174725--Sobic001G062200 Sobic006G174725--Sobic005G057600 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G174725--Sobic008G154200 Sobic006G174725--Sobic007G059800 Sobic006G174725--Sobic004G201200 Sobic004G115200--Sobic001G141000 Sobic004G115200--Sobic001G284300 Sobic004G115200--Sobic010G247700 Sobic004G115200--Sobic001G261428 Sobic004G115200--Sobic008G093101 Sobic004G115200--Sobic007G163200 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic004G115200--Sobic006G259501 Sobic004G115200--Sobic006G280700 Sobic004G115200--Sobic005G110529 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic001G025201 Sobic004G295200--Sobic007G059800 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G295200--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G295200--Sobic003G318400 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic004G295200--Sobic003G353050 Sobic004G295200--Sobic002G323800 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G295200--Sobic005G181700 Sobic004G295200--Sobic004G201200 Sobic001G141000--Sobic004G115200 Sobic001G141000--Sobic001G284300 Sobic001G141000--Sobic010G247700 Sobic001G141000--Sobic001G261428 Sobic001G141000--Sobic008G093101 Sobic001G141000--Sobic007G163200 Sobic001G141000--Sobic005G110529 Sobic001G141000--Sobic006G280700 Sobic001G141000--Sobic006G259501 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic001G025201--Sobic004G026900
Octagon: transcription factors


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