Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G163500.1
Synonym RTFL17, DVL4
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W4H2
Pfam PF08137
Panther DB PTHR33102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13245 : ROTUNDIFOLIA like 17
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g38380.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G163400 - -
2 Sobic.004G305733 - -
3 Sobic.004G072600 - -
4 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
5 Sobic.002G008400 flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed -
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7 Sobic.003G263450 - -
8 Sobic.002G149600 - -
9 Sobic.001G032850 - -
10 Sobic.004G334501 - -
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12 Sobic.009G030501 - -
13 Sobic.002G121050 - -
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15 Sobic.001G145550 - -
16 Sobic.001G154450 - -
17 Sobic.004G159866 - -
18 Sobic.007G079901 - -
19 Sobic.009G094100 - -
20 Sobic.003G172000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic002G163500--Sobic002G163400 Sobic004G305733 Sobic004G305733 Sobic002G163500--Sobic004G305733 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic002G163500--Sobic004G072600 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic002G163500--Sobic010G174000 Sobic002G008400 Sobic002G008400 Sobic002G163500--Sobic002G008400 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic002G163500--Sobic002G074700 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G163500--Sobic003G263450 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G163500--Sobic002G149600 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic002G163500--Sobic001G032850 Sobic002G163400--Sobic004G072600 Sobic002G163400--Sobic002G149600 Sobic002G163400--Sobic002G074700 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G163400--Sobic009G094100 Sobic002G163400--Sobic003G263450 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic002G163400--Sobic003G251000 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic002G163400--Sobic001G154450 Sobic002G163400--Sobic002G163500 Sobic002G163400--Sobic010G174000 Sobic009G020600 Sobic009G020600 Sobic004G305733--Sobic009G020600 Sobic004G305733--Sobic002G163400 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic004G305733--Sobic003G072000 Sobic004G305733--Sobic001G032850 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic004G305733--Sobic009G030501 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic004G305733--Sobic005G187700 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic004G305733--Sobic003G341900 Sobic004G305733--Sobic002G163500 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic004G305733--Sobic003G301050 Sobic004G072600--Sobic002G149600 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic009G094100 Sobic004G072600--Sobic002G074700 Sobic004G072600--Sobic002G163400 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic003G251000 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic004G072600--Sobic003G172000 Sobic004G072600--Sobic003G263450 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G174000--Sobic008G056000 Sobic010G174000--Sobic002G163400 Sobic010G174000--Sobic003G251000 Sobic010G174000--Sobic009G030501 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic010G174000--Sobic006G149900 Sobic010G174000--Sobic004G072600 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G174000--Sobic001G440401 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic010G174000--Sobic010G011100 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic010G174000--Sobic006G223601 Sobic002G008400--Sobic002G163500 Sobic002G008400--Sobic002G163400 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic002G008400--Sobic009G178650 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic002G008400--Sobic005G168200 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic002G008400--Sobic010G020000 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic002G008400--Sobic009G077901 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic002G008400--Sobic003G373050 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic002G008400--Sobic002G168700 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic002G008400--Sobic002G212900 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic003G263450--Sobic002G149600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic003G263450--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic002G121050 Sobic003G263450--Sobic002G074700 Sobic003G263450--Sobic003G172000 Sobic003G263450--Sobic004G072600 Sobic003G263450--Sobic006G094900 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic003G263450--Sobic004G159866 Sobic002G149600--Sobic002G074700 Sobic002G149600--Sobic002G121050 Sobic002G149600--Sobic003G172000 Sobic002G149600--Sobic003G263450 Sobic002G149600--Sobic004G072600 Sobic002G149600--Sobic009G094100 Sobic002G149600--Sobic001G154450 Sobic002G149600--Sobic006G094900 Sobic002G149600--Sobic002G163400 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic001G032850--Sobic002G118000 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic001G032850--Sobic001G249800 Sobic001G032850--Sobic003G072000 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G032850--Sobic002G134800 Sobic001G032850--Sobic002G163400 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic001G032850--Sobic009G209650 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic001G032850--Sobic005G194400 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic001G032850--Sobic002G126700 Sobic001G032850--Sobic002G074700
Octagon: transcription factors


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