Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G239800.2,Sobic.002G239800.1
Synonym Sb02g027720
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X3Q4 , A0A1W0W5I4
Pfam PF10354
Panther DB PTHR11538 PTHR11538:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19307; 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55790 : Domain of unknown function (DUF2431)
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g30210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G074500 shugoshin-1, putative, expressed -
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18 Sobic.009G073200 expressed protein -
19 Sobic.001G137050 - -
20 Sobic.003G318600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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