Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G292400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5X7P9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT76292 , PNT76293 , KQJ96609 , KQJ91407
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G183500 CC-NBS-LRR, putative, expressed -
2 Sobic.001G205600 expressed protein -
3 Sobic.005G026500 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
4 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G318350 - -
6 Sobic.004G149433 - -
7 Sobic.001G423900 - -
8 Sobic.007G003300 - -
9 Sobic.003G088300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
10 Sobic.005G017566 - -
11 Sobic.002G269800 - -
12 Sobic.002G124766 - -
13 Sobic.006G167850 - -
14 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G197350 - -
17 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
18 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G064000 expressed protein -
20 Sobic.003G146450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G292400 Sobic002G292400 Sobic007G183500 Sobic007G183500 Sobic002G292400--Sobic007G183500 Sobic001G205600 Sobic001G205600 Sobic002G292400--Sobic001G205600 Sobic005G026500 Sobic005G026500 Sobic002G292400--Sobic005G026500 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic002G292400--Sobic006G223700 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic002G292400--Sobic003G318350 Sobic004G149433 Sobic004G149433 Sobic002G292400--Sobic004G149433 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic002G292400--Sobic001G423900 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic002G292400--Sobic007G003300 Sobic003G088300 Sobic003G088300 Sobic002G292400--Sobic003G088300 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic007G183500--Sobic010G252301 Sobic010G131101 Sobic010G131101 Sobic007G183500--Sobic010G131101 Sobic007G183500--Sobic003G318350 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic007G183500--Sobic001G325500 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic007G183500--Sobic009G055700 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic007G183500--Sobic002G124766 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic007G183500--Sobic003G348300 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic007G183500--Sobic004G061300 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic007G183500--Sobic010G045966 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic001G205600--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic001G205600--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic001G205600--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic001G205600--Sobic002G269800 Sobic001G205600--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic001G205600--Sobic003G126700 Sobic003G440100 Sobic003G440100 Sobic001G205600--Sobic003G440100 Sobic001G205600--Sobic007G003300 Sobic001G205600--Sobic006G223700 Sobic003G242300 Sobic003G242300 Sobic005G026500--Sobic003G242300 Sobic005G137800 Sobic005G137800 Sobic005G026500--Sobic005G137800 Sobic005G026500--Sobic007G003300 Sobic005G026500--Sobic006G223700 Sobic005G026500--Sobic009G197350 Sobic005G026500--Sobic009G156700 Sobic005G026500--Sobic007G145300 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic005G026500--Sobic009G244450 Sobic005G026500--Sobic002G269800 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic003G318350--Sobic008G154200 Sobic003G318350--Sobic003G126700 Sobic003G318350--Sobic006G223700 Sobic003G318350--Sobic003G064000 Sobic003G318350--Sobic002G269800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G318350--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic003G318350--Sobic004G286450 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic003G318350--Sobic006G167850 Sobic003G318350--Sobic007G193000 Sobic004G149433--Sobic003G372950 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G149433--Sobic007G059800 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic004G149433--Sobic005G057600 Sobic004G149433--Sobic003G064000 Sobic004G149433--Sobic004G286450 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic004G149433--Sobic004G201200 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G149433--Sobic001G062200 Sobic004G149433--Sobic008G154200 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G149433--Sobic005G181700 Sobic001G423900--Sobic006G223700 Sobic001G423900--Sobic002G269800 Sobic001G423900--Sobic003G126700 Sobic001G423900--Sobic006G167850 Sobic001G423900--Sobic009G156700 Sobic001G423900--Sobic009G197350 Sobic003G427550 Sobic003G427550 Sobic001G423900--Sobic003G427550 Sobic001G423900--Sobic007G145300 Sobic001G423900--Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic007G145300 Sobic007G003300--Sobic009G197350 Sobic007G003300--Sobic009G156700 Sobic007G003300--Sobic002G269800 Sobic007G003300--Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic003G126700 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic007G003300--Sobic002G082350 Sobic007G003300--Sobic006G223700 Sobic007G003300--Sobic007G193000 Sobic003G088300--Sobic008G154200 Sobic003G088300--Sobic003G064000 Sobic003G088300--Sobic006G223700 Sobic003G088300--Sobic003G372950 Sobic003G088300--Sobic004G286450 Sobic003G088300--Sobic003G126700 Sobic003G088300--Sobic006G167850 Sobic003G088300--Sobic005G057600 Sobic003G088300--Sobic002G269800
Octagon: transcription factors


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