Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G026500.3,Sobic.005G026500.2
Synonym Sb05g002220, RPF2
Functional annotation Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RGC4
Pfam PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF302
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G62670 : rna processing factor 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35240.1,LOC_Os10g35240.2 : Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.007G193000 expressed protein -
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19 Sobic.001G100650 - -
20 Sobic.001G205600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G026500 Sobic005G026500 Sobic003G242300 Sobic003G242300 Sobic005G026500--Sobic003G242300 Sobic005G137800 Sobic005G137800 Sobic005G026500--Sobic005G137800 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic005G026500--Sobic007G003300 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic005G026500--Sobic006G223700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic005G026500--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic005G026500--Sobic009G156700 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic005G026500--Sobic007G145300 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic005G026500--Sobic009G244450 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic005G026500--Sobic002G269800 Sobic003G242300--Sobic005G137800 Sobic003G242300--Sobic007G145300 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G242300--Sobic002G082350 Sobic003G242300--Sobic009G197350 Sobic003G242300--Sobic009G156700 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G242300--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G242300--Sobic001G100650 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic003G242300--Sobic008G191800 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic003G242300--Sobic002G124766 Sobic005G137800--Sobic003G242300 Sobic005G137800--Sobic007G145300 Sobic005G137800--Sobic009G197350 Sobic005G137800--Sobic009G156700 Sobic005G137800--Sobic002G124766 Sobic005G137800--Sobic002G269800 Sobic005G137800--Sobic007G003300 Sobic005G137800--Sobic008G191800 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic005G137800--Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic007G145300 Sobic007G003300--Sobic009G197350 Sobic007G003300--Sobic009G156700 Sobic007G003300--Sobic002G269800 Sobic007G003300--Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic002G082350 Sobic007G003300--Sobic006G223700 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic007G003300--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic009G197350--Sobic009G156700 Sobic009G197350--Sobic007G145300 Sobic009G197350--Sobic002G269800 Sobic009G197350--Sobic003G126700 Sobic009G197350--Sobic002G124766 Sobic009G197350--Sobic007G003300 Sobic009G197350--Sobic006G223700 Sobic009G197350--Sobic002G082350 Sobic009G197350--Sobic007G193000 Sobic009G156700--Sobic009G156700 Sobic009G156700--Sobic007G145300 Sobic009G156700--Sobic002G269800 Sobic009G156700--Sobic003G126700 Sobic009G156700--Sobic002G124766 Sobic009G156700--Sobic007G003300 Sobic009G156700--Sobic006G223700 Sobic009G156700--Sobic002G082350 Sobic009G156700--Sobic007G193000 Sobic007G145300--Sobic009G197350 Sobic007G145300--Sobic009G156700 Sobic007G145300--Sobic002G269800 Sobic007G145300--Sobic002G124766 Sobic007G145300--Sobic003G126700 Sobic007G145300--Sobic007G003300 Sobic007G145300--Sobic002G082350 Sobic007G145300--Sobic006G223700 Sobic007G145300--Sobic010G064050 Sobic009G244450--Sobic008G154200 Sobic009G244450--Sobic003G242300 Sobic009G244450--Sobic003G064000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic009G244450--Sobic003G372950 Sobic009G244450--Sobic006G223700 Sobic009G244450--Sobic003G126700 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic009G244450--Sobic004G286450 Sobic009G244450--Sobic005G137800 Sobic009G244450--Sobic002G269800 Sobic002G269800--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic009G156700 Sobic002G269800--Sobic009G197350 Sobic002G269800--Sobic007G145300 Sobic002G269800--Sobic006G223700 Sobic002G269800--Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic007G193000 Sobic002G269800--Sobic007G003300 Sobic002G269800--Sobic008G154200
Octagon: transcription factors


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