Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G288900.1
Synonym Sb03g033950
Functional annotation 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q5X9
Pfam -
Panther DB PTHR13620 PTHR13620:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36110 : Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g14810.1 : 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G194600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G288900 Sobic003G288900 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G288900--Sobic010G275550 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic003G288900--Sobic001G172900 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic003G288900--Sobic008G150150 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic003G288900--Sobic008G023500 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic003G288900--Sobic010G074960 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic003G288900--Sobic003G343100 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G288900--Sobic002G205201 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G288900--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G288900--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic008G023500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic001G172900--Sobic009G164200 Sobic001G172900--Sobic002G037000 Sobic001G172900--Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic004G330500 Sobic001G172900--Sobic005G189400 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic001G172900--Sobic001G361500 Sobic001G172900--Sobic005G037500 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic008G150150--Sobic001G019100 Sobic003G335800 Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic002G037000 Sobic008G150150--Sobic010G275550 Sobic008G150150--Sobic005G037500 Sobic001G060666 Sobic001G060666 Sobic008G150150--Sobic001G060666 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic008G150150--Sobic009G004000 Sobic008G150150--Sobic001G172900 Sobic008G150150--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic010G074960--Sobic001G060666 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic010G074960--Sobic004G072950 Sobic009G249301 Sobic009G249301 Sobic010G074960--Sobic009G249301 Sobic010G074960--Sobic008G150150 Sobic010G074960--Sobic003G288900 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic010G074960--Sobic010G058650 Sobic010G074960--Sobic001G019100 Sobic010G074960--Sobic009G004000 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic010G074960--Sobic009G194600 Sobic003G343100--Sobic010G275550 Sobic003G343100--Sobic005G189400 Sobic003G343100--Sobic003G245700 Sobic003G343100--Sobic004G330500 Sobic003G343100--Sobic006G185400 Sobic003G343100--Sobic005G037500 Sobic003G343100--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic003G343100--Sobic006G090201 Sobic003G343100--Sobic002G037000 Sobic002G205201--Sobic006G185400 Sobic002G205201--Sobic004G330500 Sobic002G205201--Sobic005G189400 Sobic002G205201--Sobic010G275550 Sobic002G205201--Sobic007G152200 Sobic002G205201--Sobic001G361500 Sobic002G205201--Sobic006G209100 Sobic002G205201--Sobic008G023500 Sobic002G205201--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200
Octagon: transcription factors


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