Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G194600.1
Synonym CLE13, Sb09g025300
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z0V9
Pfam -
Panther DB PTHR34359 PTHR34359:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G73965 : CLAVATA3/ESR-RELATED 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044204
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.005G022400 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G178200 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
20 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic009G194600--Sobic003G343100 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic009G194600--Sobic010G058650 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic009G194600--Sobic010G275550 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic009G194600--Sobic003G245700 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic009G194600--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic009G194600--Sobic004G330500 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic009G194600--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic009G194600--Sobic005G189400 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic009G194600--Sobic008G023500 Sobic003G343100--Sobic010G275550 Sobic003G343100--Sobic005G189400 Sobic003G343100--Sobic003G245700 Sobic003G343100--Sobic004G330500 Sobic003G343100--Sobic006G185400 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic003G343100--Sobic005G037500 Sobic003G343100--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic003G343100--Sobic006G090201 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic003G343100--Sobic002G037000 Sobic010G058650--Sobic010G275550 Sobic006G201200 Sobic006G201200 Sobic010G058650--Sobic006G201200 Sobic010G058650--Sobic006G185400 Sobic010G058650--Sobic004G330500 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic010G058650--Sobic004G351866 Sobic010G058650--Sobic005G189400 Sobic010G058650--Sobic003G343100 Sobic010G058650--Sobic007G152200 Sobic010G058650--Sobic008G023500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic003G245700--Sobic003G178200 Sobic003G245700--Sobic005G189400 Sobic003G245700--Sobic006G185400 Sobic003G245700--Sobic004G330500 Sobic003G245700--Sobic008G023500 Sobic003G245700--Sobic006G090201 Sobic003G245700--Sobic002G205201 Sobic003G245700--Sobic007G152200 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G245700--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic006G185400--Sobic009G164200 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500
Octagon: transcription factors


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