Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G302701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZM5
Pfam PF04177
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009966; regulation of signal transduction


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53000 : 2A phosphatase associated protein of 46 kD
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04290.1 : PP2A regulatory subunit TAP46, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033433 , Zm00025a013085 , Zm00025a042465
Brachypodium KQJ92376
Barley -
Wheat TraesCS5D02G142100 , TraesCS5A02G135500 , TraesCS5B02G134400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G161100 - -
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18 Sobic.002G048300 expressed protein -
19 Sobic.008G049701 - -
20 Sobic.003G036950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G302701 Sobic003G302701 Sobic010G161100 Sobic010G161100 Sobic003G302701--Sobic010G161100 Sobic008G101350 Sobic008G101350 Sobic003G302701--Sobic008G101350 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic003G302701--Sobic001G243901 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic003G302701--Sobic008G157950 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic003G302701--Sobic002G007250 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G302701--Sobic001G287301 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic003G302701--Sobic001G345333 Sobic005G117901 Sobic005G117901 Sobic003G302701--Sobic005G117901 Sobic004G096200 Sobic004G096200 Sobic003G302701--Sobic004G096200 Sobic010G161100--Sobic003G302701 Sobic006G138933 Sobic006G138933 Sobic010G161100--Sobic006G138933 Sobic010G161100--Sobic008G101350 Sobic010G161100--Sobic001G243901 Sobic010G161100--Sobic001G345333 Sobic010G161100--Sobic002G007250 Sobic002G048300 Sobic002G048300 Sobic010G161100--Sobic002G048300 Sobic008G101350--Sobic001G243901 Sobic008G101350--Sobic005G117901 Sobic008G101350--Sobic004G096200 Sobic008G101350--Sobic003G302701 Sobic008G101350--Sobic002G048300 Sobic001G243901--Sobic005G117901 Sobic001G243901--Sobic008G101350 Sobic001G243901--Sobic001G345333 Sobic001G243901--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G243901--Sobic010G248200 Sobic001G243901--Sobic004G096200 Sobic010G218500 Sobic010G218500 Sobic001G243901--Sobic010G218500 Sobic001G243901--Sobic003G302701 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G243901--Sobic007G211000 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic008G157950--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G157950--Sobic005G110430 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G157950--Sobic004G164600 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G157950--Sobic008G049701 Sobic008G157950--Sobic001G287301 Sobic003G036950 Sobic003G036950 Sobic008G157950--Sobic003G036950 Sobic008G157950--Sobic002G007250 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G157950--Sobic001G253100 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic008G157950--Sobic004G212800 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G287301--Sobic009G209800 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic001G345333--Sobic002G007250 Sobic001G345333--Sobic002G108800 Sobic001G345333--Sobic001G243901 Sobic001G345333--Sobic004G212800 Sobic001G345333--Sobic010G248200 Sobic001G345333--Sobic004G164600 Sobic001G345333--Sobic007G073400 Sobic001G345333--Sobic002G253500 Sobic001G345333--Sobic008G042250 Sobic005G117901--Sobic001G243901 Sobic005G117901--Sobic008G101350 Sobic005G117901--Sobic004G096200 Sobic005G130450 Sobic005G130450 Sobic005G117901--Sobic005G130450 Sobic004G279300 Sobic004G279300 Sobic005G117901--Sobic004G279300 Sobic001G515600 Sobic001G515600 Sobic005G117901--Sobic001G515600 Sobic005G117901--Sobic007G211000 Sobic005G117901--Sobic002G048300 Sobic004G096200--Sobic005G117901 Sobic004G096200--Sobic008G101350 Sobic004G096200--Sobic001G243901 Sobic004G096200--Sobic005G130450 Sobic004G096200--Sobic007G211000 Sobic004G096200--Sobic010G218500 Sobic004G096200--Sobic002G048300
Octagon: transcription factors


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