Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G049701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBJ0
Pfam -
Panther DB PTHR33621 PTHR33621:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76740 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06980.1 : SAP domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025767 , Zm00025a054010
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G287301 - -
2 Sobic.008G042250 - -
3 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G110430 - -
5 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G117801 - -
8 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
9 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.008G157950 - -
12 Sobic.005G221425 - -
13 Sobic.008G079100 - -
14 Sobic.001G128800 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
17 Sobic.008G091900 - -
18 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
19 Sobic.001G272000 - -
20 Sobic.005G110427 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G049701--Sobic005G117801 SobicK009900 SobicK009900 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic005G117801--Sobic001G253100 Sobic005G117801--Sobic008G091900 Sobic005G117801--Sobic009G209800 Sobic005G117801--Sobic001G240400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic008G049701 Sobic005G117801--Sobic005G110430 Sobic005G117801--Sobic008G042250 Sobic005G117801--SobicK009900 SobicK009900--Sobic004G076732 SobicK009900--Sobic005G110430 SobicK009900--Sobic001G253100 SobicK009900--Sobic008G042250 SobicK009900--Sobic008G049701 SobicK009900--Sobic002G410200 SobicK009900--Sobic001G287301 SobicK009900--Sobic005G117801 SobicK009900--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425
Octagon: transcription factors


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