Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G221425.1,Sobic.005G221425.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJZ1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.008G049701 - -
6 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
8 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
10 Sobic.002G062300 expressed protein -
11 Sobic.008G042250 - -
12 Sobic.008G079100 - -
13 Sobic.005G110430 - -
14 Sobic.005G117801 - -
15 Sobic.001G287301 - -
16 Sobic.009G113600 - -
17 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G089650 - -
19 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
20 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein


Gene co-expression network
sample Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G221425--Sobic009G209800 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G221425--Sobic001G240400 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G221425--Sobic001G253100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G009500 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G221425--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G221425--Sobic002G056100 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G221425--SobicK024000 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G221425--Sobic005G139800 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G221425--Sobic004G076732 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic005G221425 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic008G049701 Sobic002G056100--Sobic001G253100 Sobic002G056100--Sobic005G117801 Sobic002G056100--Sobic001G305400 Sobic002G056100--Sobic008G042250 Sobic002G056100--Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic002G221200 SobicK024000--Sobic008G009500 SobicK024000--Sobic009G113600 SobicK024000--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic009G209800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 SobicK024000--Sobic008G079100 SobicK024000--Sobic002G221200 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G076732--Sobic004G212800
Octagon: transcription factors


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