Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K009900.1
Synonym APG8H, ATG8I
Functional annotation autophagy-related protein 8D, putative, expressed
UniProt C6JS83 , A0A120GUM8
Pfam PF02991
Panther DB PTHR10969 PTHR10969:SF25
NCBI CDD KOG1654; Microtubule-associated anchor protein involved in autophagy and membrane trafficking
KEGG Orthology K08341; GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15580 : Ubiquitin-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01010.1 : autophagy-related protein 8D, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G049440.1 , HORVU5Hr1G049440.2 , HORVU5Hr1G049440.3 , HORVU5Hr1G049440.4
Wheat TraesCS5D02G163400 , TraesCS5A02G158000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 SobicK009900--Sobic004G076732 Sobic005G110430 Sobic005G110430 SobicK009900--Sobic005G110430 Sobic001G253100 Sobic001G253100 SobicK009900--Sobic001G253100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 SobicK009900--Sobic008G042250 Sobic008G049701 Sobic008G049701 SobicK009900--Sobic008G049701 Sobic002G410200 Sobic002G410200 SobicK009900--Sobic002G410200 Sobic001G287301 Sobic001G287301 SobicK009900--Sobic001G287301 Sobic005G117801 Sobic005G117801 SobicK009900--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 SobicK009900--Sobic009G209800 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G076732--Sobic004G212800 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic002G410200--Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic009G209800 Sobic002G410200--SobicK009900 Sobic002G410200--Sobic001G253100 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic005G139800 Sobic002G410200--Sobic008G042250 Sobic002G410200--Sobic008G009500 Sobic002G410200--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic005G117801--Sobic001G253100 Sobic005G117801--Sobic008G091900 Sobic005G117801--Sobic009G209800 Sobic005G117801--Sobic001G240400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic008G049701 Sobic005G117801--Sobic005G110430 Sobic005G117801--Sobic008G042250 Sobic005G117801--SobicK009900 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200
Octagon: transcription factors


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