Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G212800.1,Sobic.004G212800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YR00 , A0A194YR01
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G164600 - -
3 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G345333 - -
5 Sobic.002G007250 - -
6 Sobic.010G248200 KID-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
8 Sobic.008G161401 - -
9 Sobic.004G112500 - -
10 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
11 Sobic.008G042250 - -
12 Sobic.005G110430 - -
13 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
14 Sobic.002G108800 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
15 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.008G167300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G143700 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
18 Sobic.008G157950 - -
19 Sobic.002G253500 FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K00306: sarcosine oxidase / L-pipecolate oxidase
20 Sobic.002G283300 protein kinase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic001G024200--Sobic004G212800 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic004G112500 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic001G024200--Sobic003G204000 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic004G164600 Sobic001G024200--SobicK009900 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic010G248200 Sobic001G345333--Sobic002G007250 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic001G345333--Sobic002G108800 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic001G345333--Sobic001G243901 Sobic001G345333--Sobic004G212800 Sobic001G345333--Sobic010G248200 Sobic001G345333--Sobic004G164600 Sobic001G345333--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic001G345333--Sobic002G253500 Sobic001G345333--Sobic008G042250 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic010G248200--Sobic002G007250 Sobic010G248200--Sobic001G345333 Sobic010G248200--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic010G248200--Sobic005G130200 Sobic010G248200--Sobic002G253500 Sobic010G248200--Sobic008G161401 Sobic010G248200--Sobic002G108800 Sobic010G248200--Sobic001G243901 Sobic010G218500 Sobic010G218500 Sobic010G248200--Sobic010G218500 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G076732--Sobic004G212800 Sobic008G161401--Sobic010G248200 Sobic008G161401--Sobic004G212800 Sobic008G161401--Sobic007G073400 Sobic008G161401--Sobic005G130200 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic008G161401--Sobic003G057800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic008G161401--Sobic003G357500 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic008G161401--Sobic009G156000 Sobic008G161401--Sobic002G108800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic008G161401--Sobic001G479500 Sobic004G112500--Sobic001G024200 Sobic004G112500--Sobic004G212800 Sobic004G112500--Sobic007G211000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic004G112500--Sobic001G543900 Sobic004G112500--Sobic004G164600 Sobic004G112500--Sobic010G248200 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic004G112500--Sobic010G124001 Sobic004G112500--Sobic008G157950 Sobic004G112500--Sobic008G042250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.