Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G345333.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S953
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G007250 - -
2 Sobic.002G108800 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
3 Sobic.001G243901 - -
4 Sobic.004G212800 - -
5 Sobic.010G248200 KID-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G164600 - -
7 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
8 Sobic.002G253500 FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K00306: sarcosine oxidase / L-pipecolate oxidase
9 Sobic.008G042250 - -
10 Sobic.005G110430 - -
11 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
12 Sobic.008G031350 - -
13 Sobic.008G157950 - -
14 Sobic.001G287301 - -
15 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.007G156500 alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
18 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
19 Sobic.002G283300 protein kinase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G101350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic001G345333--Sobic002G007250 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic001G345333--Sobic002G108800 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic001G345333--Sobic001G243901 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G345333--Sobic004G212800 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G345333--Sobic010G248200 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic001G345333--Sobic004G164600 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic001G345333--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic001G345333--Sobic002G253500 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G345333--Sobic008G042250 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic002G108800--Sobic007G156500 Sobic002G108800--Sobic002G007250 Sobic002G108800--Sobic001G345333 Sobic002G108800--Sobic002G253500 Sobic002G108800--Sobic010G248200 Sobic002G108800--Sobic004G212800 Sobic002G039500 Sobic002G039500 Sobic002G108800--Sobic002G039500 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic002G108800--Sobic007G023700 Sobic002G108800--Sobic007G073400 Sobic005G117901 Sobic005G117901 Sobic001G243901--Sobic005G117901 Sobic008G101350 Sobic008G101350 Sobic001G243901--Sobic008G101350 Sobic001G243901--Sobic001G345333 Sobic001G243901--Sobic002G007250 Sobic001G243901--Sobic010G248200 Sobic004G096200 Sobic004G096200 Sobic001G243901--Sobic004G096200 Sobic010G218500 Sobic010G218500 Sobic001G243901--Sobic010G218500 Sobic003G302701 Sobic003G302701 Sobic001G243901--Sobic003G302701 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G243901--Sobic007G211000 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic010G248200--Sobic002G007250 Sobic010G248200--Sobic001G345333 Sobic010G248200--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic010G248200--Sobic005G130200 Sobic010G248200--Sobic002G253500 Sobic010G248200--Sobic008G161401 Sobic010G248200--Sobic002G108800 Sobic010G248200--Sobic001G243901 Sobic010G248200--Sobic010G218500 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic002G253500--Sobic010G248200 Sobic002G253500--Sobic002G108800 Sobic002G253500--Sobic007G156500 Sobic002G253500--Sobic002G039500 Sobic002G253500--Sobic001G345333 Sobic002G253500--Sobic002G007250 Sobic002G253500--Sobic004G212800 Sobic002G253500--Sobic010G218500 Sobic002G253500--Sobic008G161401 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic004G164600
Octagon: transcription factors


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