Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G031350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5G8
Pfam PF05729
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF586
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53496.1 : NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G084100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G113600 - -
2 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
4 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
5 Sobic.002G062300 expressed protein -
6 Sobic.004G164600 - -
7 Sobic.002G007250 - -
8 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
10 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
11 Sobic.008G042250 - -
12 Sobic.001G345333 - -
13 Sobic.005G110430 - -
14 Sobic.004G212800 - -
15 Sobic.007G059300 - -
16 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.010G050600 - -
18 Sobic.002G108800 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
19 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G157950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G031350--Sobic009G113600 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic008G031350--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G031350--SobicK024000 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic008G031350--Sobic007G073400 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G031350--Sobic002G062300 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G031350--Sobic004G164600 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic008G031350--Sobic002G007250 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G031350--Sobic005G212600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G031350--Sobic006G132200 Sobic009G113600--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G113600--Sobic007G059300 Sobic009G113600--SobicK024000 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic008G009500 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic009G113600--Sobic008G108900 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G113600--Sobic003G031750 Sobic009G113600--Sobic008G031350 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic009G113600--Sobic010G146200 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G009500--Sobic005G221425 SobicK024000--Sobic008G009500 SobicK024000--Sobic009G113600 SobicK024000--Sobic002G062300 SobicK024000--Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic009G209800 SobicK024000--Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 SobicK024000--Sobic008G079100 Sobic002G221200 Sobic002G221200 SobicK024000--Sobic002G221200 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic002G062300--Sobic009G113600 Sobic002G062300--Sobic007G059300 Sobic002G062300--SobicK024000 Sobic002G062300--Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic003G031750 Sobic002G062300--Sobic008G009500 Sobic002G062300--Sobic008G108900 Sobic002G062300--Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic001G253100 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic008G009500 Sobic005G212600--SobicK024000 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic006G132200--Sobic008G031350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.