Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G167300.2
Synonym Sb08g021280
Functional annotation NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R718
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF586
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53496.1 : NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G212800 - -
2 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
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6 Sobic.004G164600 - -
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10 Sobic.008G157950 - -
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12 Sobic.001G272000 - -
13 Sobic.008G042250 - -
14 Sobic.001G271900 - -
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16 Sobic.001G345333 - -
17 Sobic.010G146700 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed K15015: SLC32A, solute carrier family 32 (vesicular inhibitory amino acid transporter)
18 Sobic.010G124001 - -
19 Sobic.006G088580 - -
20 Sobic.005G110430 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic008G167300--Sobic004G212800 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic008G167300--Sobic004G016500 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic008G167300--Sobic001G046600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G167300--Sobic001G024200 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic008G167300--Sobic008G161401 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G167300--Sobic004G164600 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic008G167300--Sobic004G112500 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic008G167300--Sobic002G007250 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G167300--Sobic003G424100 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic004G016500--Sobic001G046600 Sobic002G150766 Sobic002G150766 Sobic004G016500--Sobic002G150766 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic004G016500--Sobic002G330400 Sobic004G016500--Sobic008G167300 Sobic004G016500--Sobic004G212800 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G016500--Sobic003G057800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic004G016500--Sobic001G479500 Sobic004G016500--Sobic004G164600 Sobic004G016500--Sobic003G424100 Sobic001G046600--Sobic004G016500 Sobic001G046600--Sobic004G212800 Sobic001G046600--Sobic004G164600 Sobic001G046600--Sobic007G073400 Sobic001G046600--Sobic003G424100 Sobic001G046600--Sobic004G112500 Sobic001G046600--Sobic008G167300 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G046600--Sobic008G157950 Sobic008G176732 Sobic008G176732 Sobic001G046600--Sobic008G176732 Sobic001G024200--Sobic004G212800 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic004G112500 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic001G024200--Sobic003G204000 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic004G164600 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G024200--SobicK009900 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic010G248200 Sobic008G161401--Sobic010G248200 Sobic008G161401--Sobic004G212800 Sobic008G161401--Sobic007G073400 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic008G161401--Sobic005G130200 Sobic008G161401--Sobic003G057800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic008G161401--Sobic003G357500 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic008G161401--Sobic009G156000 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic008G161401--Sobic002G108800 Sobic008G161401--Sobic001G479500 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic002G007250 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic004G112500--Sobic001G024200 Sobic004G112500--Sobic004G212800 Sobic004G112500--Sobic007G211000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic004G112500--Sobic001G543900 Sobic004G112500--Sobic004G164600 Sobic004G112500--Sobic010G248200 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic004G112500--Sobic010G124001 Sobic004G112500--Sobic008G157950 Sobic004G112500--Sobic008G042250 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic003G424100--Sobic008G068800
Octagon: transcription factors


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