Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G272000.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S837
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G271900 - -
2 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
3 Sobic.001G287301 - -
4 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G049701 - -
6 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
7 Sobic.008G042250 - -
8 Sobic.007G211000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G110430 - -
10 Sobic.001G271801 - -
11 Sobic.004G112500 - -
12 Sobic.002G166700 cyclin, putative, expressed -
13 Sobic.004G212800 - -
14 Sobic.008G157950 - -
15 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
17 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G079100 - -
19 Sobic.004G164600 - -
20 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic001G272000--Sobic001G271900 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G272000--SobicK009900 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic001G272000--Sobic001G287301 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic001G272000--Sobic001G024200 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G272000--Sobic008G049701 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G272000--Sobic001G543900 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G272000--Sobic008G042250 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G272000--Sobic007G211000 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G272000--Sobic005G110430 Sobic001G271900--Sobic001G272000 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic001G271900--Sobic010G124001 Sobic001G271900--Sobic001G543900 Sobic001G271900--Sobic007G211000 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic001G271900--Sobic001G271801 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic001G271900--Sobic004G112500 Sobic002G166700 Sobic002G166700 Sobic001G271900--Sobic002G166700 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G271900--Sobic009G104300 Sobic001G271900--Sobic001G287301 Sobic004G076732 Sobic004G076732 SobicK009900--Sobic004G076732 SobicK009900--Sobic005G110430 Sobic001G253100 Sobic001G253100 SobicK009900--Sobic001G253100 SobicK009900--Sobic008G042250 SobicK009900--Sobic008G049701 Sobic002G410200 Sobic002G410200 SobicK009900--Sobic002G410200 SobicK009900--Sobic001G287301 Sobic005G117801 Sobic005G117801 SobicK009900--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 SobicK009900--Sobic009G209800 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G024200--Sobic004G212800 Sobic001G024200--Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic004G112500 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic001G024200--Sobic003G204000 Sobic001G024200--Sobic001G272000 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic001G024200--Sobic004G164600 Sobic001G024200--SobicK009900 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic001G439500 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G024200--Sobic010G248200 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G543900--Sobic001G477800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G543900--Sobic002G313300 Sobic001G543900--Sobic004G112500 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic001G543900--Sobic002G001600 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G543900--Sobic006G009400 Sobic001G543900--Sobic002G166700 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic001G543900--Sobic005G130200 Sobic001G543900--Sobic001G272000 Sobic001G543900--Sobic010G248200 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic007G211000--Sobic001G024200 Sobic007G211000--Sobic004G112500 Sobic007G211000--Sobic010G124001 Sobic003G117000 Sobic003G117000 Sobic007G211000--Sobic003G117000 Sobic007G211000--Sobic001G272000 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic007G211000--Sobic001G243901 Sobic005G117901 Sobic005G117901 Sobic007G211000--Sobic005G117901 Sobic007G211000--Sobic004G212800 Sobic007G211000--Sobic010G248200 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800
Octagon: transcription factors


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