Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G209800.1
Synonym Sb09g026600
Functional annotation OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R4I8
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF147
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10340 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g41650.1 : OsFBX392 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK04243
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G049701 - -
2 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G042250 - -
6 Sobic.005G117801 - -
7 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.005G221425 - -
9 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
11 Sobic.001G287301 - -
12 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G110430 - -
14 Sobic.008G036500 - -
15 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
17 Sobic.008G079100 - -
18 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
19 Sobic.002G062300 expressed protein -
20 Sobic.008G091900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 SobicK009900 SobicK009900 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic005G117801--Sobic001G253100 Sobic005G117801--Sobic008G091900 Sobic005G117801--Sobic009G209800 Sobic005G117801--Sobic001G240400 Sobic005G117801--Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic008G049701 Sobic005G117801--Sobic005G110430 Sobic005G117801--Sobic008G042250 Sobic005G117801--SobicK009900 Sobic002G056100--Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic008G049701 Sobic002G056100--Sobic001G253100 Sobic002G056100--Sobic005G117801 Sobic002G056100--Sobic001G305400 Sobic002G056100--Sobic008G042250 Sobic002G056100--Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic002G221200 Sobic005G221425--Sobic009G209800 Sobic005G221425--Sobic001G240400 Sobic005G221425--Sobic001G253100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G049701 Sobic005G221425--Sobic002G056100 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G221425--SobicK024000 Sobic005G221425--Sobic005G139800 Sobic005G221425--Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic009G209800 Sobic002G410200--SobicK009900 Sobic002G410200--Sobic001G253100 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic005G139800 Sobic002G410200--Sobic008G042250 Sobic002G410200--Sobic008G009500 Sobic002G410200--Sobic008G049701
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.