Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G117801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIL6 , C6JSE7
Pfam -
Panther DB PTHR33087 PTHR33087:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g50230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G091900 - -
3 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G049701 - -
7 Sobic.005G110430 - -
8 Sobic.008G042250 - -
9 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
10 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
11 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.008G036500 - -
13 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
15 Sobic.003G031750 - -
16 Sobic.001G287301 - -
17 Sobic.005G221425 - -
18 Sobic.001G267233 - -
19 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
20 Sobic.004G092300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G117801--Sobic001G253100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic005G117801--Sobic008G091900 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G117801--Sobic009G209800 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G117801--Sobic001G240400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G117801--Sobic002G221200 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G117801--Sobic008G049701 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G117801--Sobic005G110430 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G117801--Sobic008G042250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic005G117801--SobicK009900 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic002G221200--Sobic003G031750 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic004G164600 SobicK009900--Sobic004G076732 SobicK009900--Sobic005G110430 SobicK009900--Sobic001G253100 SobicK009900--Sobic008G042250 SobicK009900--Sobic008G049701 SobicK009900--Sobic002G410200 SobicK009900--Sobic001G287301 SobicK009900--Sobic005G117801 SobicK009900--Sobic009G209800
Octagon: transcription factors


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